Protein–RNA interactions for Protein: P48431

SOX2, Transcription factor SOX-2, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOX2P48431 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SOX2P48431 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SOX2P48431 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SOX2P48431 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SOX2P48431 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SOX2P48431 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SOX2P48431 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SOX2P48431 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SOX2P48431 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SOX2P48431 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SOX2P48431 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SOX2P48431 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SOX2P48431 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SOX2P48431 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SOX2P48431 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SOX2P48431 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SOX2P48431 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SOX2P48431 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SOX2P48431 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SOX2P48431 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SOX2P48431 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SOX2P48431 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SOX2P48431 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SOX2P48431 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SOX2P48431 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SOX2P48431 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SOX2P48431 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SOX2P48431 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SOX2P48431 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SOX2P48431 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SOX2P48431 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SOX2P48431 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SOX2P48431 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SOX2P48431 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SOX2P48431 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SOX2P48431 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SOX2P48431 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SOX2P48431 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SOX2P48431 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SOX2P48431 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SOX2P48431 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SOX2P48431 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SOX2P48431 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SOX2P48431 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SOX2P48431 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SOX2P48431 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SOX2P48431 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SOX2P48431 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SOX2P48431 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SOX2P48431 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SOX2P48431 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SOX2P48431 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SOX2P48431 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SOX2P48431 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SOX2P48431 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SOX2P48431 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SOX2P48431 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SOX2P48431 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SOX2P48431 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SOX2P48431 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SOX2P48431 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SOX2P48431 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SOX2P48431 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SOX2P48431 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SOX2P48431 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SOX2P48431 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SOX2P48431 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SOX2P48431 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SOX2P48431 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SOX2P48431 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SOX2P48431 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SOX2P48431 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SOX2P48431 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SOX2P48431 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SOX2P48431 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SOX2P48431 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SOX2P48431 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
SOX2P48431 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SOX2P48431 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SOX2P48431 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SOX2P48431 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SOX2P48431 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SOX2P48431 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SOX2P48431 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SOX2P48431 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SOX2P48431 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SOX2P48431 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SOX2P48431 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SOX2P48431 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SOX2P48431 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SOX2P48431 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SOX2P48431 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
SOX2P48431 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
SOX2P48431 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
SOX2P48431 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
SOX2P48431 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
SOX2P48431 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
SOX2P48431 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
SOX2P48431 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SOX2P48431 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.5 ms