Protein–RNA interactions for Protein: P48169

GABRA4, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 554 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRA4P48169 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GABRA4P48169 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GABRA4P48169 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GABRA4P48169 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GABRA4P48169 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GABRA4P48169 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GABRA4P48169 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GABRA4P48169 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GABRA4P48169 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GABRA4P48169 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GABRA4P48169 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GABRA4P48169 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GABRA4P48169 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GABRA4P48169 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GABRA4P48169 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GABRA4P48169 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GABRA4P48169 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GABRA4P48169 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GABRA4P48169 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GABRA4P48169 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GABRA4P48169 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GABRA4P48169 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GABRA4P48169 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GABRA4P48169 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
GABRA4P48169 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
GABRA4P48169 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GABRA4P48169 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GABRA4P48169 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GABRA4P48169 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GABRA4P48169 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
GABRA4P48169 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GABRA4P48169 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GABRA4P48169 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GABRA4P48169 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
GABRA4P48169 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GABRA4P48169 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GABRA4P48169 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GABRA4P48169 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GABRA4P48169 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GABRA4P48169 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GABRA4P48169 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GABRA4P48169 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GABRA4P48169 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
GABRA4P48169 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GABRA4P48169 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GABRA4P48169 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GABRA4P48169 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GABRA4P48169 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GABRA4P48169 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GABRA4P48169 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GABRA4P48169 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GABRA4P48169 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
GABRA4P48169 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
GABRA4P48169 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GABRA4P48169 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GABRA4P48169 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GABRA4P48169 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GABRA4P48169 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GABRA4P48169 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GABRA4P48169 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
GABRA4P48169 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
GABRA4P48169 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
GABRA4P48169 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
GABRA4P48169 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC17.12■□□□□ 0.33
GABRA4P48169 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
GABRA4P48169 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC17.12■□□□□ 0.33
GABRA4P48169 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
GABRA4P48169 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
GABRA4P48169 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GABRA4P48169 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
GABRA4P48169 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GABRA4P48169 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
GABRA4P48169 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GABRA4P48169 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
GABRA4P48169 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GABRA4P48169 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GABRA4P48169 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
GABRA4P48169 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GABRA4P48169 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GABRA4P48169 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GABRA4P48169 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GABRA4P48169 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GABRA4P48169 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
GABRA4P48169 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
GABRA4P48169 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
GABRA4P48169 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
GABRA4P48169 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
GABRA4P48169 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
GABRA4P48169 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
GABRA4P48169 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
GABRA4P48169 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
GABRA4P48169 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
GABRA4P48169 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
GABRA4P48169 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
GABRA4P48169 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
GABRA4P48169 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
GABRA4P48169 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
GABRA4P48169 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
GABRA4P48169 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
GABRA4P48169 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms