Protein–RNA interactions for Protein: P45954

ACADSB, Short/branched chain specific acyl-CoA dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACADSBP45954 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
ACADSBP45954 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ACADSBP45954 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ACADSBP45954 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ACADSBP45954 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ACADSBP45954 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
ACADSBP45954 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ACADSBP45954 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
ACADSBP45954 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
ACADSBP45954 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
ACADSBP45954 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC19.02■□□□□ 0.63
ACADSBP45954 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
ACADSBP45954 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
ACADSBP45954 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
ACADSBP45954 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ACADSBP45954 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ACADSBP45954 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ACADSBP45954 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ACADSBP45954 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ACADSBP45954 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ACADSBP45954 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ACADSBP45954 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ACADSBP45954 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ACADSBP45954 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ACADSBP45954 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ACADSBP45954 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ACADSBP45954 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ACADSBP45954 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ACADSBP45954 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ACADSBP45954 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ACADSBP45954 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ACADSBP45954 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ACADSBP45954 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ACADSBP45954 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ACADSBP45954 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ACADSBP45954 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ACADSBP45954 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ACADSBP45954 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ACADSBP45954 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ACADSBP45954 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ACADSBP45954 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ACADSBP45954 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ACADSBP45954 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ACADSBP45954 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ACADSBP45954 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ACADSBP45954 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ACADSBP45954 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ACADSBP45954 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ACADSBP45954 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ACADSBP45954 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ACADSBP45954 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ACADSBP45954 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
ACADSBP45954 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ACADSBP45954 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ACADSBP45954 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ACADSBP45954 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ACADSBP45954 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ACADSBP45954 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ACADSBP45954 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ACADSBP45954 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
ACADSBP45954 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
ACADSBP45954 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ACADSBP45954 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
ACADSBP45954 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
ACADSBP45954 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
ACADSBP45954 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
ACADSBP45954 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
ACADSBP45954 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
ACADSBP45954 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC19■□□□□ 0.63
ACADSBP45954 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC19■□□□□ 0.63
ACADSBP45954 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
ACADSBP45954 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ACADSBP45954 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
ACADSBP45954 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
ACADSBP45954 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
ACADSBP45954 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ACADSBP45954 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
ACADSBP45954 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ACADSBP45954 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
ACADSBP45954 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
ACADSBP45954 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ACADSBP45954 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ACADSBP45954 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ACADSBP45954 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ACADSBP45954 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ACADSBP45954 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ACADSBP45954 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ACADSBP45954 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ACADSBP45954 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ACADSBP45954 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ACADSBP45954 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ACADSBP45954 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
ACADSBP45954 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ACADSBP45954 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ACADSBP45954 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ACADSBP45954 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ACADSBP45954 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
ACADSBP45954 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ACADSBP45954 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ACADSBP45954 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.8 ms