Protein–RNA interactions for Protein: P43897

TSFM, Elongation factor Ts, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSFMP43897 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
TSFMP43897 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
TSFMP43897 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TSFMP43897 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TSFMP43897 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TSFMP43897 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TSFMP43897 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TSFMP43897 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TSFMP43897 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TSFMP43897 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TSFMP43897 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TSFMP43897 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TSFMP43897 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TSFMP43897 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TSFMP43897 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TSFMP43897 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TSFMP43897 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TSFMP43897 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TSFMP43897 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TSFMP43897 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TSFMP43897 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TSFMP43897 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TSFMP43897 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TSFMP43897 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TSFMP43897 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TSFMP43897 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TSFMP43897 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TSFMP43897 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
TSFMP43897 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TSFMP43897 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TSFMP43897 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TSFMP43897 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TSFMP43897 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TSFMP43897 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TSFMP43897 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TSFMP43897 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TSFMP43897 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TSFMP43897 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TSFMP43897 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TSFMP43897 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TSFMP43897 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
TSFMP43897 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TSFMP43897 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TSFMP43897 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TSFMP43897 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
TSFMP43897 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TSFMP43897 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TSFMP43897 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TSFMP43897 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TSFMP43897 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TSFMP43897 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TSFMP43897 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TSFMP43897 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TSFMP43897 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TSFMP43897 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TSFMP43897 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TSFMP43897 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TSFMP43897 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TSFMP43897 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TSFMP43897 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TSFMP43897 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TSFMP43897 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TSFMP43897 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TSFMP43897 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TSFMP43897 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TSFMP43897 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TSFMP43897 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TSFMP43897 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TSFMP43897 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TSFMP43897 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TSFMP43897 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TSFMP43897 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TSFMP43897 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TSFMP43897 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TSFMP43897 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
TSFMP43897 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TSFMP43897 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TSFMP43897 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TSFMP43897 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TSFMP43897 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TSFMP43897 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TSFMP43897 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TSFMP43897 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TSFMP43897 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TSFMP43897 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TSFMP43897 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TSFMP43897 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TSFMP43897 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TSFMP43897 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TSFMP43897 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TSFMP43897 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TSFMP43897 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TSFMP43897 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TSFMP43897 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TSFMP43897 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TSFMP43897 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TSFMP43897 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TSFMP43897 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TSFMP43897 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TSFMP43897 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms