Protein–RNA interactions for Protein: P43694

GATA4, Transcription factor GATA-4, humanhuman

Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GATA4P43694 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GATA4P43694 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GATA4P43694 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GATA4P43694 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GATA4P43694 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GATA4P43694 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GATA4P43694 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GATA4P43694 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GATA4P43694 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GATA4P43694 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GATA4P43694 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
GATA4P43694 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GATA4P43694 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GATA4P43694 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GATA4P43694 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
GATA4P43694 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GATA4P43694 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GATA4P43694 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GATA4P43694 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GATA4P43694 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GATA4P43694 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GATA4P43694 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
GATA4P43694 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GATA4P43694 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GATA4P43694 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GATA4P43694 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GATA4P43694 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GATA4P43694 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GATA4P43694 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GATA4P43694 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GATA4P43694 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GATA4P43694 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GATA4P43694 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GATA4P43694 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GATA4P43694 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GATA4P43694 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GATA4P43694 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GATA4P43694 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GATA4P43694 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GATA4P43694 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GATA4P43694 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GATA4P43694 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GATA4P43694 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GATA4P43694 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GATA4P43694 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GATA4P43694 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GATA4P43694 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GATA4P43694 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GATA4P43694 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GATA4P43694 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GATA4P43694 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
GATA4P43694 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
GATA4P43694 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GATA4P43694 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GATA4P43694 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
GATA4P43694 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GATA4P43694 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GATA4P43694 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GATA4P43694 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GATA4P43694 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GATA4P43694 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GATA4P43694 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GATA4P43694 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GATA4P43694 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GATA4P43694 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GATA4P43694 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GATA4P43694 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GATA4P43694 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
GATA4P43694 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GATA4P43694 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GATA4P43694 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GATA4P43694 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GATA4P43694 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GATA4P43694 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GATA4P43694 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GATA4P43694 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GATA4P43694 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GATA4P43694 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GATA4P43694 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GATA4P43694 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GATA4P43694 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GATA4P43694 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GATA4P43694 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GATA4P43694 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GATA4P43694 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GATA4P43694 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GATA4P43694 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GATA4P43694 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GATA4P43694 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GATA4P43694 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
GATA4P43694 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GATA4P43694 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GATA4P43694 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GATA4P43694 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GATA4P43694 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GATA4P43694 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GATA4P43694 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GATA4P43694 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GATA4P43694 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GATA4P43694 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms