Protein–RNA interactions for Protein: P43155

CRAT, Carnitine O-acetyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 626 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRATP43155 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CRATP43155 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CRATP43155 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CRATP43155 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CRATP43155 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CRATP43155 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CRATP43155 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CRATP43155 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CRATP43155 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CRATP43155 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CRATP43155 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CRATP43155 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CRATP43155 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CRATP43155 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CRATP43155 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CRATP43155 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CRATP43155 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CRATP43155 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CRATP43155 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CRATP43155 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CRATP43155 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CRATP43155 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CRATP43155 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CRATP43155 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CRATP43155 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CRATP43155 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
CRATP43155 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CRATP43155 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CRATP43155 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CRATP43155 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CRATP43155 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CRATP43155 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CRATP43155 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CRATP43155 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CRATP43155 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CRATP43155 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CRATP43155 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CRATP43155 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CRATP43155 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CRATP43155 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CRATP43155 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CRATP43155 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CRATP43155 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CRATP43155 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CRATP43155 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CRATP43155 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CRATP43155 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CRATP43155 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CRATP43155 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CRATP43155 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CRATP43155 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CRATP43155 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CRATP43155 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
CRATP43155 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CRATP43155 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CRATP43155 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CRATP43155 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CRATP43155 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CRATP43155 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CRATP43155 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CRATP43155 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CRATP43155 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CRATP43155 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CRATP43155 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
CRATP43155 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CRATP43155 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CRATP43155 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CRATP43155 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CRATP43155 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CRATP43155 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CRATP43155 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CRATP43155 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
CRATP43155 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CRATP43155 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CRATP43155 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CRATP43155 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CRATP43155 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CRATP43155 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CRATP43155 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CRATP43155 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CRATP43155 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CRATP43155 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CRATP43155 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CRATP43155 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CRATP43155 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CRATP43155 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CRATP43155 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CRATP43155 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CRATP43155 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CRATP43155 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CRATP43155 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
CRATP43155 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CRATP43155 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CRATP43155 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
CRATP43155 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
CRATP43155 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CRATP43155 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
CRATP43155 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CRATP43155 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CRATP43155 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.5 ms