Protein–RNA interactions for Protein: P42126

ECI1, Enoyl-CoA delta isomerase 1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 302 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECI1P42126 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ECI1P42126 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
ECI1P42126 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ECI1P42126 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ECI1P42126 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ECI1P42126 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ECI1P42126 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ECI1P42126 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ECI1P42126 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ECI1P42126 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ECI1P42126 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ECI1P42126 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ECI1P42126 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ECI1P42126 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ECI1P42126 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ECI1P42126 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ECI1P42126 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ECI1P42126 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ECI1P42126 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ECI1P42126 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ECI1P42126 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ECI1P42126 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ECI1P42126 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ECI1P42126 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ECI1P42126 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ECI1P42126 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ECI1P42126 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ECI1P42126 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ECI1P42126 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ECI1P42126 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ECI1P42126 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ECI1P42126 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ECI1P42126 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ECI1P42126 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ECI1P42126 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ECI1P42126 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ECI1P42126 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ECI1P42126 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ECI1P42126 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ECI1P42126 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ECI1P42126 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ECI1P42126 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ECI1P42126 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ECI1P42126 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ECI1P42126 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ECI1P42126 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ECI1P42126 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ECI1P42126 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ECI1P42126 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ECI1P42126 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ECI1P42126 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ECI1P42126 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ECI1P42126 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ECI1P42126 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ECI1P42126 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ECI1P42126 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ECI1P42126 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ECI1P42126 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ECI1P42126 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ECI1P42126 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ECI1P42126 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ECI1P42126 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ECI1P42126 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ECI1P42126 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ECI1P42126 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ECI1P42126 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ECI1P42126 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ECI1P42126 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ECI1P42126 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ECI1P42126 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ECI1P42126 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ECI1P42126 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ECI1P42126 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ECI1P42126 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ECI1P42126 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ECI1P42126 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ECI1P42126 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ECI1P42126 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ECI1P42126 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ECI1P42126 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ECI1P42126 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ECI1P42126 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ECI1P42126 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ECI1P42126 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
ECI1P42126 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ECI1P42126 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ECI1P42126 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
ECI1P42126 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ECI1P42126 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ECI1P42126 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ECI1P42126 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ECI1P42126 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ECI1P42126 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ECI1P42126 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ECI1P42126 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ECI1P42126 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ECI1P42126 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ECI1P42126 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ECI1P42126 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ECI1P42126 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.6 ms