Protein–RNA interactions for Protein: P38571

LIPA, Lysosomal acid lipase/cholesteryl ester hydrolase, humanhuman

Predictions only

Length 399 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIPAP38571 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LIPAP38571 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LIPAP38571 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LIPAP38571 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LIPAP38571 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LIPAP38571 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LIPAP38571 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LIPAP38571 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LIPAP38571 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LIPAP38571 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LIPAP38571 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LIPAP38571 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LIPAP38571 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LIPAP38571 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LIPAP38571 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LIPAP38571 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LIPAP38571 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LIPAP38571 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
LIPAP38571 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
LIPAP38571 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LIPAP38571 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LIPAP38571 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LIPAP38571 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LIPAP38571 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LIPAP38571 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
LIPAP38571 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LIPAP38571 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LIPAP38571 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LIPAP38571 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LIPAP38571 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LIPAP38571 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LIPAP38571 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LIPAP38571 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LIPAP38571 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LIPAP38571 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LIPAP38571 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
LIPAP38571 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
LIPAP38571 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
LIPAP38571 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
LIPAP38571 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
LIPAP38571 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
LIPAP38571 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
LIPAP38571 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
LIPAP38571 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
LIPAP38571 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
LIPAP38571 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
LIPAP38571 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
LIPAP38571 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
LIPAP38571 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
LIPAP38571 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
LIPAP38571 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
LIPAP38571 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
LIPAP38571 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
LIPAP38571 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
LIPAP38571 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
LIPAP38571 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
LIPAP38571 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
LIPAP38571 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
LIPAP38571 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.23
LIPAP38571 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
LIPAP38571 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
LIPAP38571 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
LIPAP38571 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
LIPAP38571 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
LIPAP38571 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
LIPAP38571 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
LIPAP38571 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LIPAP38571 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LIPAP38571 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LIPAP38571 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LIPAP38571 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LIPAP38571 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LIPAP38571 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LIPAP38571 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LIPAP38571 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LIPAP38571 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LIPAP38571 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LIPAP38571 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LIPAP38571 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LIPAP38571 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LIPAP38571 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LIPAP38571 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LIPAP38571 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
LIPAP38571 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LIPAP38571 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LIPAP38571 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LIPAP38571 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LIPAP38571 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LIPAP38571 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LIPAP38571 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LIPAP38571 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LIPAP38571 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LIPAP38571 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LIPAP38571 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LIPAP38571 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LIPAP38571 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LIPAP38571 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
LIPAP38571 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LIPAP38571 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LIPAP38571 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms