Protein–RNA interactions for Protein: P37231

PPARG, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 505 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPARGP37231 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PPARGP37231 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PPARGP37231 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PPARGP37231 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PPARGP37231 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PPARGP37231 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PPARGP37231 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PPARGP37231 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PPARGP37231 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PPARGP37231 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PPARGP37231 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
PPARGP37231 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
PPARGP37231 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PPARGP37231 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PPARGP37231 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PPARGP37231 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PPARGP37231 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PPARGP37231 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PPARGP37231 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PPARGP37231 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
PPARGP37231 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
PPARGP37231 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
PPARGP37231 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PPARGP37231 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PPARGP37231 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PPARGP37231 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PPARGP37231 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PPARGP37231 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PPARGP37231 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PPARGP37231 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PPARGP37231 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PPARGP37231 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PPARGP37231 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PPARGP37231 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PPARGP37231 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PPARGP37231 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PPARGP37231 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PPARGP37231 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PPARGP37231 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PPARGP37231 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PPARGP37231 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
PPARGP37231 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PPARGP37231 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PPARGP37231 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
PPARGP37231 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PPARGP37231 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PPARGP37231 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PPARGP37231 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PPARGP37231 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PPARGP37231 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PPARGP37231 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PPARGP37231 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PPARGP37231 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PPARGP37231 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PPARGP37231 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PPARGP37231 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PPARGP37231 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PPARGP37231 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PPARGP37231 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PPARGP37231 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PPARGP37231 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PPARGP37231 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PPARGP37231 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PPARGP37231 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PPARGP37231 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PPARGP37231 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PPARGP37231 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PPARGP37231 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PPARGP37231 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PPARGP37231 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PPARGP37231 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PPARGP37231 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PPARGP37231 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PPARGP37231 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PPARGP37231 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PPARGP37231 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PPARGP37231 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
PPARGP37231 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
PPARGP37231 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PPARGP37231 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PPARGP37231 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PPARGP37231 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PPARGP37231 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PPARGP37231 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PPARGP37231 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PPARGP37231 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PPARGP37231 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PPARGP37231 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PPARGP37231 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PPARGP37231 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PPARGP37231 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PPARGP37231 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PPARGP37231 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PPARGP37231 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PPARGP37231 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PPARGP37231 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PPARGP37231 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PPARGP37231 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PPARGP37231 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PPARGP37231 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.8 ms