Protein–RNA interactions for Protein: P36980

CFHR2, Complement factor H-related protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFHR2P36980 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CFHR2P36980 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CFHR2P36980 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CFHR2P36980 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CFHR2P36980 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CFHR2P36980 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CFHR2P36980 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CFHR2P36980 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CFHR2P36980 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CFHR2P36980 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CFHR2P36980 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CFHR2P36980 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CFHR2P36980 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CFHR2P36980 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CFHR2P36980 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CFHR2P36980 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CFHR2P36980 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CFHR2P36980 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CFHR2P36980 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CFHR2P36980 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CFHR2P36980 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CFHR2P36980 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CFHR2P36980 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CFHR2P36980 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CFHR2P36980 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CFHR2P36980 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CFHR2P36980 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CFHR2P36980 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CFHR2P36980 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CFHR2P36980 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CFHR2P36980 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CFHR2P36980 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CFHR2P36980 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CFHR2P36980 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CFHR2P36980 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CFHR2P36980 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CFHR2P36980 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CFHR2P36980 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CFHR2P36980 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CFHR2P36980 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CFHR2P36980 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CFHR2P36980 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CFHR2P36980 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CFHR2P36980 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CFHR2P36980 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CFHR2P36980 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CFHR2P36980 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CFHR2P36980 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CFHR2P36980 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CFHR2P36980 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CFHR2P36980 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CFHR2P36980 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CFHR2P36980 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CFHR2P36980 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CFHR2P36980 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CFHR2P36980 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CFHR2P36980 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CFHR2P36980 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CFHR2P36980 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CFHR2P36980 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CFHR2P36980 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CFHR2P36980 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CFHR2P36980 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CFHR2P36980 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CFHR2P36980 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CFHR2P36980 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CFHR2P36980 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CFHR2P36980 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CFHR2P36980 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CFHR2P36980 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CFHR2P36980 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CFHR2P36980 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CFHR2P36980 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CFHR2P36980 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CFHR2P36980 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CFHR2P36980 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CFHR2P36980 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CFHR2P36980 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CFHR2P36980 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CFHR2P36980 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CFHR2P36980 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CFHR2P36980 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CFHR2P36980 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CFHR2P36980 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CFHR2P36980 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CFHR2P36980 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CFHR2P36980 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CFHR2P36980 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CFHR2P36980 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CFHR2P36980 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CFHR2P36980 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CFHR2P36980 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CFHR2P36980 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CFHR2P36980 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CFHR2P36980 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CFHR2P36980 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CFHR2P36980 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CFHR2P36980 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CFHR2P36980 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CFHR2P36980 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.4 ms