Protein–RNA interactions for Protein: P36871

PGM1, Phosphoglucomutase-1, humanhuman

Predictions only

Length 562 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGM1P36871 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PGM1P36871 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PGM1P36871 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PGM1P36871 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PGM1P36871 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PGM1P36871 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PGM1P36871 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PGM1P36871 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PGM1P36871 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PGM1P36871 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PGM1P36871 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PGM1P36871 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PGM1P36871 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PGM1P36871 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PGM1P36871 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PGM1P36871 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PGM1P36871 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PGM1P36871 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
PGM1P36871 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PGM1P36871 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PGM1P36871 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PGM1P36871 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PGM1P36871 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PGM1P36871 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PGM1P36871 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
PGM1P36871 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
PGM1P36871 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PGM1P36871 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PGM1P36871 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PGM1P36871 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PGM1P36871 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PGM1P36871 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PGM1P36871 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PGM1P36871 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PGM1P36871 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PGM1P36871 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PGM1P36871 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PGM1P36871 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PGM1P36871 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PGM1P36871 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PGM1P36871 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PGM1P36871 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
PGM1P36871 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
PGM1P36871 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PGM1P36871 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PGM1P36871 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
PGM1P36871 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PGM1P36871 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PGM1P36871 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PGM1P36871 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PGM1P36871 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PGM1P36871 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PGM1P36871 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PGM1P36871 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PGM1P36871 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PGM1P36871 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PGM1P36871 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PGM1P36871 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PGM1P36871 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PGM1P36871 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PGM1P36871 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PGM1P36871 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PGM1P36871 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PGM1P36871 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PGM1P36871 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PGM1P36871 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PGM1P36871 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PGM1P36871 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PGM1P36871 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PGM1P36871 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PGM1P36871 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
PGM1P36871 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PGM1P36871 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PGM1P36871 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PGM1P36871 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PGM1P36871 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
PGM1P36871 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PGM1P36871 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PGM1P36871 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PGM1P36871 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PGM1P36871 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PGM1P36871 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PGM1P36871 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PGM1P36871 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PGM1P36871 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PGM1P36871 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PGM1P36871 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PGM1P36871 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PGM1P36871 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PGM1P36871 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PGM1P36871 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PGM1P36871 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PGM1P36871 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PGM1P36871 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PGM1P36871 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PGM1P36871 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PGM1P36871 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PGM1P36871 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PGM1P36871 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PGM1P36871 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms