Protein–RNA interactions for Protein: P36543

ATP6V1E1, V-type proton ATPase subunit E 1, humanhuman

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP6V1E1P36543 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATP6V1E1P36543 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATP6V1E1P36543 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATP6V1E1P36543 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATP6V1E1P36543 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATP6V1E1P36543 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATP6V1E1P36543 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATP6V1E1P36543 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATP6V1E1P36543 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATP6V1E1P36543 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATP6V1E1P36543 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATP6V1E1P36543 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATP6V1E1P36543 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
ATP6V1E1P36543 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATP6V1E1P36543 CUL3-202ENST00000344951 6592 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATP6V1E1P36543 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATP6V1E1P36543 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATP6V1E1P36543 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATP6V1E1P36543 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATP6V1E1P36543 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATP6V1E1P36543 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATP6V1E1P36543 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATP6V1E1P36543 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATP6V1E1P36543 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATP6V1E1P36543 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATP6V1E1P36543 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATP6V1E1P36543 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATP6V1E1P36543 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATP6V1E1P36543 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ATP6V1E1P36543 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ATP6V1E1P36543 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ATP6V1E1P36543 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ATP6V1E1P36543 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ATP6V1E1P36543 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ATP6V1E1P36543 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ATP6V1E1P36543 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ATP6V1E1P36543 COL5A1-208ENST00000618395 8437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ATP6V1E1P36543 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ATP6V1E1P36543 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ATP6V1E1P36543 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ATP6V1E1P36543 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ATP6V1E1P36543 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ATP6V1E1P36543 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ATP6V1E1P36543 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
ATP6V1E1P36543 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ATP6V1E1P36543 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ATP6V1E1P36543 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ATP6V1E1P36543 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ATP6V1E1P36543 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ATP6V1E1P36543 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ATP6V1E1P36543 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ATP6V1E1P36543 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ATP6V1E1P36543 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ATP6V1E1P36543 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ATP6V1E1P36543 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ATP6V1E1P36543 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
ATP6V1E1P36543 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ATP6V1E1P36543 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ATP6V1E1P36543 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ATP6V1E1P36543 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ATP6V1E1P36543 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ATP6V1E1P36543 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
ATP6V1E1P36543 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ATP6V1E1P36543 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ATP6V1E1P36543 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
ATP6V1E1P36543 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
ATP6V1E1P36543 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ATP6V1E1P36543 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ATP6V1E1P36543 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ATP6V1E1P36543 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
ATP6V1E1P36543 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
ATP6V1E1P36543 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
ATP6V1E1P36543 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATP6V1E1P36543 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATP6V1E1P36543 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATP6V1E1P36543 PHLDB1-223ENST00000600882 5479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATP6V1E1P36543 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATP6V1E1P36543 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATP6V1E1P36543 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATP6V1E1P36543 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATP6V1E1P36543 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATP6V1E1P36543 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATP6V1E1P36543 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATP6V1E1P36543 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATP6V1E1P36543 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATP6V1E1P36543 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATP6V1E1P36543 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATP6V1E1P36543 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATP6V1E1P36543 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
ATP6V1E1P36543 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATP6V1E1P36543 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATP6V1E1P36543 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATP6V1E1P36543 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATP6V1E1P36543 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATP6V1E1P36543 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATP6V1E1P36543 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATP6V1E1P36543 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATP6V1E1P36543 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATP6V1E1P36543 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATP6V1E1P36543 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms