Protein–RNA interactions for Protein: P29965

CD40LG, CD40 ligand, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD40LGP29965 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CD40LGP29965 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CD40LGP29965 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CD40LGP29965 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CD40LGP29965 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CD40LGP29965 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CD40LGP29965 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CD40LGP29965 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CD40LGP29965 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CD40LGP29965 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CD40LGP29965 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CD40LGP29965 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CD40LGP29965 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CD40LGP29965 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CD40LGP29965 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CD40LGP29965 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CD40LGP29965 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CD40LGP29965 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CD40LGP29965 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CD40LGP29965 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CD40LGP29965 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CD40LGP29965 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CD40LGP29965 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CD40LGP29965 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CD40LGP29965 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CD40LGP29965 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CD40LGP29965 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CD40LGP29965 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CD40LGP29965 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CD40LGP29965 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CD40LGP29965 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CD40LGP29965 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CD40LGP29965 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CD40LGP29965 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CD40LGP29965 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CD40LGP29965 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CD40LGP29965 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CD40LGP29965 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CD40LGP29965 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CD40LGP29965 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CD40LGP29965 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CD40LGP29965 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CD40LGP29965 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CD40LGP29965 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CD40LGP29965 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CD40LGP29965 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CD40LGP29965 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
CD40LGP29965 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CD40LGP29965 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CD40LGP29965 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CD40LGP29965 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CD40LGP29965 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CD40LGP29965 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CD40LGP29965 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CD40LGP29965 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CD40LGP29965 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CD40LGP29965 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CD40LGP29965 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CD40LGP29965 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CD40LGP29965 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CD40LGP29965 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CD40LGP29965 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CD40LGP29965 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CD40LGP29965 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CD40LGP29965 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CD40LGP29965 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CD40LGP29965 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CD40LGP29965 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CD40LGP29965 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CD40LGP29965 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CD40LGP29965 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CD40LGP29965 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CD40LGP29965 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CD40LGP29965 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CD40LGP29965 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CD40LGP29965 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CD40LGP29965 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CD40LGP29965 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CD40LGP29965 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CD40LGP29965 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CD40LGP29965 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CD40LGP29965 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CD40LGP29965 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CD40LGP29965 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CD40LGP29965 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CD40LGP29965 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CD40LGP29965 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CD40LGP29965 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CD40LGP29965 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CD40LGP29965 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CD40LGP29965 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CD40LGP29965 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CD40LGP29965 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CD40LGP29965 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CD40LGP29965 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CD40LGP29965 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CD40LGP29965 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CD40LGP29965 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CD40LGP29965 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CD40LGP29965 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms