Protein–RNA interactions for Protein: P29466

CASP1, Caspase-1, humanhuman

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP1P29466 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CASP1P29466 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CASP1P29466 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CASP1P29466 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CASP1P29466 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CASP1P29466 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CASP1P29466 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CASP1P29466 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CASP1P29466 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CASP1P29466 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CASP1P29466 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CASP1P29466 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CASP1P29466 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CASP1P29466 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CASP1P29466 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CASP1P29466 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CASP1P29466 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
CASP1P29466 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CASP1P29466 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CASP1P29466 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CASP1P29466 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
CASP1P29466 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
CASP1P29466 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
CASP1P29466 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.83
CASP1P29466 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
CASP1P29466 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
CASP1P29466 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
CASP1P29466 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
CASP1P29466 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
CASP1P29466 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CASP1P29466 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CASP1P29466 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CASP1P29466 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CASP1P29466 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CASP1P29466 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CASP1P29466 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CASP1P29466 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CASP1P29466 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CASP1P29466 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CASP1P29466 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CASP1P29466 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CASP1P29466 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CASP1P29466 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
CASP1P29466 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CASP1P29466 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
CASP1P29466 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CASP1P29466 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CASP1P29466 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CASP1P29466 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CASP1P29466 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CASP1P29466 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CASP1P29466 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CASP1P29466 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
CASP1P29466 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CASP1P29466 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CASP1P29466 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CASP1P29466 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CASP1P29466 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CASP1P29466 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CASP1P29466 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CASP1P29466 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CASP1P29466 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CASP1P29466 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CASP1P29466 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CASP1P29466 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CASP1P29466 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CASP1P29466 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CASP1P29466 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CASP1P29466 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CASP1P29466 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CASP1P29466 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CASP1P29466 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CASP1P29466 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CASP1P29466 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CASP1P29466 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CASP1P29466 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
CASP1P29466 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CASP1P29466 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
CASP1P29466 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CASP1P29466 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CASP1P29466 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CASP1P29466 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CASP1P29466 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
CASP1P29466 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CASP1P29466 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CASP1P29466 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CASP1P29466 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CASP1P29466 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CASP1P29466 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CASP1P29466 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CASP1P29466 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CASP1P29466 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CASP1P29466 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CASP1P29466 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CASP1P29466 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CASP1P29466 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CASP1P29466 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CASP1P29466 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CASP1P29466 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CASP1P29466 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.5 ms