Protein–RNA interactions for Protein: P27695

APEX1, DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APEX1P27695 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
APEX1P27695 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
APEX1P27695 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
APEX1P27695 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
APEX1P27695 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
APEX1P27695 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
APEX1P27695 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
APEX1P27695 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
APEX1P27695 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
APEX1P27695 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
APEX1P27695 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
APEX1P27695 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
APEX1P27695 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
APEX1P27695 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
APEX1P27695 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
APEX1P27695 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
APEX1P27695 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
APEX1P27695 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
APEX1P27695 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
APEX1P27695 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
APEX1P27695 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
APEX1P27695 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
APEX1P27695 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
APEX1P27695 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
APEX1P27695 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
APEX1P27695 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
APEX1P27695 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
APEX1P27695 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
APEX1P27695 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
APEX1P27695 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
APEX1P27695 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
APEX1P27695 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
APEX1P27695 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
APEX1P27695 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
APEX1P27695 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
APEX1P27695 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
APEX1P27695 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
APEX1P27695 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
APEX1P27695 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
APEX1P27695 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
APEX1P27695 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
APEX1P27695 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
APEX1P27695 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
APEX1P27695 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
APEX1P27695 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
APEX1P27695 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
APEX1P27695 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
APEX1P27695 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
APEX1P27695 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
APEX1P27695 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
APEX1P27695 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
APEX1P27695 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
APEX1P27695 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
APEX1P27695 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
APEX1P27695 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
APEX1P27695 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
APEX1P27695 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
APEX1P27695 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
APEX1P27695 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
APEX1P27695 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
APEX1P27695 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
APEX1P27695 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
APEX1P27695 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
APEX1P27695 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
APEX1P27695 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
APEX1P27695 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
APEX1P27695 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
APEX1P27695 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
APEX1P27695 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
APEX1P27695 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
APEX1P27695 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
APEX1P27695 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
APEX1P27695 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
APEX1P27695 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
APEX1P27695 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
APEX1P27695 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
APEX1P27695 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
APEX1P27695 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
APEX1P27695 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
APEX1P27695 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
APEX1P27695 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
APEX1P27695 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
APEX1P27695 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
APEX1P27695 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
APEX1P27695 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
APEX1P27695 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
APEX1P27695 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
APEX1P27695 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
APEX1P27695 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
APEX1P27695 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
APEX1P27695 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
APEX1P27695 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
APEX1P27695 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
APEX1P27695 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
APEX1P27695 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
APEX1P27695 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
APEX1P27695 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
APEX1P27695 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
APEX1P27695 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
APEX1P27695 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.6 ms