Protein–RNA interactions for Protein: P25105

PTAFR, Platelet-activating factor receptor, humanhuman

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTAFRP25105 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PTAFRP25105 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PTAFRP25105 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PTAFRP25105 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PTAFRP25105 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PTAFRP25105 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PTAFRP25105 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
PTAFRP25105 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PTAFRP25105 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PTAFRP25105 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PTAFRP25105 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
PTAFRP25105 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PTAFRP25105 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PTAFRP25105 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PTAFRP25105 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PTAFRP25105 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PTAFRP25105 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PTAFRP25105 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PTAFRP25105 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PTAFRP25105 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PTAFRP25105 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PTAFRP25105 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PTAFRP25105 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PTAFRP25105 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PTAFRP25105 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PTAFRP25105 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PTAFRP25105 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PTAFRP25105 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PTAFRP25105 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PTAFRP25105 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PTAFRP25105 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PTAFRP25105 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PTAFRP25105 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PTAFRP25105 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PTAFRP25105 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PTAFRP25105 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
PTAFRP25105 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PTAFRP25105 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PTAFRP25105 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PTAFRP25105 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PTAFRP25105 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PTAFRP25105 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PTAFRP25105 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
PTAFRP25105 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
PTAFRP25105 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PTAFRP25105 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PTAFRP25105 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PTAFRP25105 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PTAFRP25105 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PTAFRP25105 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PTAFRP25105 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PTAFRP25105 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PTAFRP25105 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PTAFRP25105 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PTAFRP25105 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PTAFRP25105 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PTAFRP25105 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
PTAFRP25105 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PTAFRP25105 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PTAFRP25105 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PTAFRP25105 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PTAFRP25105 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PTAFRP25105 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PTAFRP25105 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PTAFRP25105 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PTAFRP25105 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PTAFRP25105 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PTAFRP25105 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PTAFRP25105 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PTAFRP25105 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PTAFRP25105 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PTAFRP25105 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PTAFRP25105 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PTAFRP25105 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PTAFRP25105 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PTAFRP25105 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PTAFRP25105 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PTAFRP25105 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
PTAFRP25105 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PTAFRP25105 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PTAFRP25105 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PTAFRP25105 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PTAFRP25105 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PTAFRP25105 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PTAFRP25105 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PTAFRP25105 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PTAFRP25105 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PTAFRP25105 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PTAFRP25105 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PTAFRP25105 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PTAFRP25105 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PTAFRP25105 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
PTAFRP25105 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PTAFRP25105 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PTAFRP25105 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PTAFRP25105 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PTAFRP25105 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PTAFRP25105 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PTAFRP25105 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PTAFRP25105 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms