Protein–RNA interactions for Protein: P24928

POLR2A, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,970 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2AP24928 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
POLR2AP24928 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
POLR2AP24928 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
POLR2AP24928 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
POLR2AP24928 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
POLR2AP24928 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
POLR2AP24928 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
POLR2AP24928 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
POLR2AP24928 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
POLR2AP24928 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
POLR2AP24928 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
POLR2AP24928 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
POLR2AP24928 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
POLR2AP24928 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
POLR2AP24928 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
POLR2AP24928 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
POLR2AP24928 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
POLR2AP24928 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
POLR2AP24928 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
POLR2AP24928 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
POLR2AP24928 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
POLR2AP24928 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
POLR2AP24928 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
POLR2AP24928 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
POLR2AP24928 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
POLR2AP24928 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC21.16■□□□□ 0.98
POLR2AP24928 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
POLR2AP24928 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
POLR2AP24928 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
POLR2AP24928 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC21.16■□□□□ 0.98
POLR2AP24928 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
POLR2AP24928 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
POLR2AP24928 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
POLR2AP24928 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
POLR2AP24928 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
POLR2AP24928 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
POLR2AP24928 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
POLR2AP24928 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
POLR2AP24928 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
POLR2AP24928 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
POLR2AP24928 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
POLR2AP24928 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
POLR2AP24928 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
POLR2AP24928 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
POLR2AP24928 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
POLR2AP24928 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
POLR2AP24928 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
POLR2AP24928 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC21.16■□□□□ 0.98
POLR2AP24928 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
POLR2AP24928 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
POLR2AP24928 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
POLR2AP24928 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
POLR2AP24928 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
POLR2AP24928 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC21.16■□□□□ 0.98
POLR2AP24928 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
POLR2AP24928 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
POLR2AP24928 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
POLR2AP24928 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
POLR2AP24928 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
POLR2AP24928 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
POLR2AP24928 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
POLR2AP24928 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
POLR2AP24928 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
POLR2AP24928 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
POLR2AP24928 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
POLR2AP24928 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
POLR2AP24928 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
POLR2AP24928 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
POLR2AP24928 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
POLR2AP24928 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
POLR2AP24928 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
POLR2AP24928 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
POLR2AP24928 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
POLR2AP24928 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC21.14■□□□□ 0.98
POLR2AP24928 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
POLR2AP24928 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
POLR2AP24928 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.98
POLR2AP24928 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
POLR2AP24928 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
POLR2AP24928 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
POLR2AP24928 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
POLR2AP24928 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
POLR2AP24928 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
POLR2AP24928 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
POLR2AP24928 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
POLR2AP24928 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
POLR2AP24928 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
POLR2AP24928 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
POLR2AP24928 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
POLR2AP24928 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
POLR2AP24928 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
POLR2AP24928 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
POLR2AP24928 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
POLR2AP24928 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
POLR2AP24928 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
POLR2AP24928 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
POLR2AP24928 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
POLR2AP24928 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
POLR2AP24928 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
POLR2AP24928 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.7 ms