Protein–RNA interactions for Protein: P23763

VAMP1, Vesicle-associated membrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP1P23763 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
VAMP1P23763 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
VAMP1P23763 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
VAMP1P23763 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
VAMP1P23763 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
VAMP1P23763 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
VAMP1P23763 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
VAMP1P23763 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
VAMP1P23763 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
VAMP1P23763 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
VAMP1P23763 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
VAMP1P23763 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
VAMP1P23763 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
VAMP1P23763 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
VAMP1P23763 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
VAMP1P23763 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
VAMP1P23763 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
VAMP1P23763 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
VAMP1P23763 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
VAMP1P23763 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
VAMP1P23763 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
VAMP1P23763 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
VAMP1P23763 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
VAMP1P23763 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
VAMP1P23763 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
VAMP1P23763 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
VAMP1P23763 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
VAMP1P23763 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
VAMP1P23763 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
VAMP1P23763 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
VAMP1P23763 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
VAMP1P23763 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
VAMP1P23763 SSR1P1-201ENST00000407630 814 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
VAMP1P23763 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
VAMP1P23763 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
VAMP1P23763 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
VAMP1P23763 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
VAMP1P23763 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
VAMP1P23763 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
VAMP1P23763 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
VAMP1P23763 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
VAMP1P23763 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
VAMP1P23763 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
VAMP1P23763 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
VAMP1P23763 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
VAMP1P23763 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
VAMP1P23763 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
VAMP1P23763 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
VAMP1P23763 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
VAMP1P23763 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
VAMP1P23763 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
VAMP1P23763 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
VAMP1P23763 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
VAMP1P23763 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
VAMP1P23763 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
VAMP1P23763 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
VAMP1P23763 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
VAMP1P23763 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
VAMP1P23763 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
VAMP1P23763 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
VAMP1P23763 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
VAMP1P23763 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
VAMP1P23763 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
VAMP1P23763 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
VAMP1P23763 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
VAMP1P23763 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
VAMP1P23763 HCG24-202ENST00000414398 717 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
VAMP1P23763 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
VAMP1P23763 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
VAMP1P23763 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
VAMP1P23763 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
VAMP1P23763 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
VAMP1P23763 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
VAMP1P23763 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
VAMP1P23763 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
VAMP1P23763 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
VAMP1P23763 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
VAMP1P23763 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
VAMP1P23763 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
VAMP1P23763 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
VAMP1P23763 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
VAMP1P23763 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
VAMP1P23763 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
VAMP1P23763 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
VAMP1P23763 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
VAMP1P23763 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
VAMP1P23763 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
VAMP1P23763 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
VAMP1P23763 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
VAMP1P23763 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
VAMP1P23763 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
VAMP1P23763 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
VAMP1P23763 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
VAMP1P23763 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
VAMP1P23763 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
VAMP1P23763 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
VAMP1P23763 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
VAMP1P23763 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
VAMP1P23763 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
VAMP1P23763 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms