Protein–RNA interactions for Protein: P23469

PTPRE, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, humanhuman

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Length 700 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPREP23469 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
PTPREP23469 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PTPREP23469 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PTPREP23469 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PTPREP23469 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PTPREP23469 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PTPREP23469 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
PTPREP23469 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PTPREP23469 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PTPREP23469 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PTPREP23469 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PTPREP23469 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PTPREP23469 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PTPREP23469 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PTPREP23469 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PTPREP23469 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PTPREP23469 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PTPREP23469 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PTPREP23469 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PTPREP23469 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PTPREP23469 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PTPREP23469 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PTPREP23469 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PTPREP23469 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PTPREP23469 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
PTPREP23469 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
PTPREP23469 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
PTPREP23469 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
PTPREP23469 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
PTPREP23469 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
PTPREP23469 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
PTPREP23469 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PTPREP23469 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PTPREP23469 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PTPREP23469 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PTPREP23469 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PTPREP23469 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PTPREP23469 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PTPREP23469 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PTPREP23469 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PTPREP23469 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PTPREP23469 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
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PTPREP23469 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PTPREP23469 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PTPREP23469 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PTPREP23469 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PTPREP23469 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PTPREP23469 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PTPREP23469 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PTPREP23469 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PTPREP23469 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PTPREP23469 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PTPREP23469 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PTPREP23469 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PTPREP23469 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PTPREP23469 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PTPREP23469 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
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PTPREP23469 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PTPREP23469 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PTPREP23469 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PTPREP23469 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PTPREP23469 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PTPREP23469 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PTPREP23469 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PTPREP23469 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PTPREP23469 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PTPREP23469 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PTPREP23469 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PTPREP23469 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PTPREP23469 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PTPREP23469 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
PTPREP23469 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PTPREP23469 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PTPREP23469 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PTPREP23469 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PTPREP23469 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PTPREP23469 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PTPREP23469 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PTPREP23469 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PTPREP23469 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PTPREP23469 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PTPREP23469 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PTPREP23469 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PTPREP23469 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
PTPREP23469 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PTPREP23469 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PTPREP23469 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PTPREP23469 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PTPREP23469 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PTPREP23469 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PTPREP23469 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PTPREP23469 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PTPREP23469 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PTPREP23469 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PTPREP23469 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PTPREP23469 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
PTPREP23469 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PTPREP23469 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
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