Protein–RNA interactions for Protein: P23443

RPS6KB1, Ribosomal protein S6 kinase beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 525 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS6KB1P23443 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RPS6KB1P23443 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RPS6KB1P23443 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RPS6KB1P23443 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RPS6KB1P23443 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RPS6KB1P23443 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RPS6KB1P23443 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RPS6KB1P23443 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RPS6KB1P23443 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RPS6KB1P23443 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RPS6KB1P23443 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RPS6KB1P23443 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RPS6KB1P23443 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RPS6KB1P23443 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RPS6KB1P23443 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RPS6KB1P23443 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RPS6KB1P23443 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RPS6KB1P23443 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RPS6KB1P23443 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RPS6KB1P23443 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RPS6KB1P23443 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
RPS6KB1P23443 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RPS6KB1P23443 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
RPS6KB1P23443 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RPS6KB1P23443 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RPS6KB1P23443 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RPS6KB1P23443 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RPS6KB1P23443 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RPS6KB1P23443 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RPS6KB1P23443 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RPS6KB1P23443 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RPS6KB1P23443 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RPS6KB1P23443 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RPS6KB1P23443 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
RPS6KB1P23443 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RPS6KB1P23443 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RPS6KB1P23443 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RPS6KB1P23443 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RPS6KB1P23443 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RPS6KB1P23443 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RPS6KB1P23443 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RPS6KB1P23443 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RPS6KB1P23443 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RPS6KB1P23443 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RPS6KB1P23443 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RPS6KB1P23443 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RPS6KB1P23443 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RPS6KB1P23443 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RPS6KB1P23443 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RPS6KB1P23443 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RPS6KB1P23443 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RPS6KB1P23443 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RPS6KB1P23443 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RPS6KB1P23443 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
RPS6KB1P23443 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RPS6KB1P23443 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RPS6KB1P23443 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RPS6KB1P23443 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RPS6KB1P23443 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RPS6KB1P23443 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RPS6KB1P23443 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RPS6KB1P23443 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RPS6KB1P23443 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RPS6KB1P23443 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RPS6KB1P23443 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RPS6KB1P23443 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RPS6KB1P23443 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RPS6KB1P23443 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RPS6KB1P23443 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RPS6KB1P23443 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RPS6KB1P23443 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
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RPS6KB1P23443 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RPS6KB1P23443 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RPS6KB1P23443 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RPS6KB1P23443 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RPS6KB1P23443 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RPS6KB1P23443 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RPS6KB1P23443 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RPS6KB1P23443 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RPS6KB1P23443 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RPS6KB1P23443 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RPS6KB1P23443 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RPS6KB1P23443 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RPS6KB1P23443 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RPS6KB1P23443 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RPS6KB1P23443 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RPS6KB1P23443 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RPS6KB1P23443 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
RPS6KB1P23443 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
RPS6KB1P23443 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RPS6KB1P23443 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RPS6KB1P23443 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RPS6KB1P23443 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RPS6KB1P23443 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RPS6KB1P23443 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RPS6KB1P23443 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RPS6KB1P23443 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RPS6KB1P23443 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
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