Protein–RNA interactions for Protein: P19876

CXCL3, C-X-C motif chemokine 3, humanhuman

Predictions only

Length 107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL3P19876 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CXCL3P19876 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CXCL3P19876 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
CXCL3P19876 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CXCL3P19876 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CXCL3P19876 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CXCL3P19876 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CXCL3P19876 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CXCL3P19876 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CXCL3P19876 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CXCL3P19876 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CXCL3P19876 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CXCL3P19876 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CXCL3P19876 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CXCL3P19876 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CXCL3P19876 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CXCL3P19876 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CXCL3P19876 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CXCL3P19876 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CXCL3P19876 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CXCL3P19876 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CXCL3P19876 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CXCL3P19876 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CXCL3P19876 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CXCL3P19876 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CXCL3P19876 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CXCL3P19876 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CXCL3P19876 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CXCL3P19876 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CXCL3P19876 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CXCL3P19876 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CXCL3P19876 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CXCL3P19876 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CXCL3P19876 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CXCL3P19876 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CXCL3P19876 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CXCL3P19876 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CXCL3P19876 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CXCL3P19876 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
CXCL3P19876 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CXCL3P19876 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CXCL3P19876 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CXCL3P19876 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CXCL3P19876 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CXCL3P19876 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CXCL3P19876 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CXCL3P19876 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CXCL3P19876 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CXCL3P19876 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CXCL3P19876 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CXCL3P19876 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
CXCL3P19876 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CXCL3P19876 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CXCL3P19876 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CXCL3P19876 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CXCL3P19876 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CXCL3P19876 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CXCL3P19876 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CXCL3P19876 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CXCL3P19876 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CXCL3P19876 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CXCL3P19876 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CXCL3P19876 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CXCL3P19876 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CXCL3P19876 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CXCL3P19876 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CXCL3P19876 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CXCL3P19876 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CXCL3P19876 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CXCL3P19876 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CXCL3P19876 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CXCL3P19876 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CXCL3P19876 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CXCL3P19876 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CXCL3P19876 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CXCL3P19876 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CXCL3P19876 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CXCL3P19876 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CXCL3P19876 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CXCL3P19876 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CXCL3P19876 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CXCL3P19876 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CXCL3P19876 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CXCL3P19876 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CXCL3P19876 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CXCL3P19876 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CXCL3P19876 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CXCL3P19876 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CXCL3P19876 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CXCL3P19876 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CXCL3P19876 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CXCL3P19876 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CXCL3P19876 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CXCL3P19876 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CXCL3P19876 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CXCL3P19876 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CXCL3P19876 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CXCL3P19876 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CXCL3P19876 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CXCL3P19876 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms