Protein–RNA interactions for Protein: P19474

TRIM21, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM21, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM21P19474 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
TRIM21P19474 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TRIM21P19474 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TRIM21P19474 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TRIM21P19474 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TRIM21P19474 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
TRIM21P19474 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
TRIM21P19474 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
TRIM21P19474 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
TRIM21P19474 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
TRIM21P19474 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC20.02■□□□□ 0.79
TRIM21P19474 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
TRIM21P19474 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TRIM21P19474 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TRIM21P19474 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TRIM21P19474 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TRIM21P19474 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TRIM21P19474 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TRIM21P19474 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TRIM21P19474 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TRIM21P19474 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TRIM21P19474 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TRIM21P19474 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TRIM21P19474 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TRIM21P19474 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TRIM21P19474 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TRIM21P19474 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TRIM21P19474 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TRIM21P19474 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TRIM21P19474 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TRIM21P19474 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TRIM21P19474 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TRIM21P19474 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TRIM21P19474 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TRIM21P19474 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TRIM21P19474 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TRIM21P19474 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TRIM21P19474 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TRIM21P19474 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TRIM21P19474 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TRIM21P19474 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TRIM21P19474 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TRIM21P19474 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
TRIM21P19474 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TRIM21P19474 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TRIM21P19474 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TRIM21P19474 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TRIM21P19474 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TRIM21P19474 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TRIM21P19474 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TRIM21P19474 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TRIM21P19474 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TRIM21P19474 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
TRIM21P19474 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TRIM21P19474 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TRIM21P19474 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TRIM21P19474 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TRIM21P19474 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TRIM21P19474 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TRIM21P19474 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC20■□□□□ 0.79
TRIM21P19474 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
TRIM21P19474 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TRIM21P19474 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TRIM21P19474 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TRIM21P19474 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
TRIM21P19474 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TRIM21P19474 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TRIM21P19474 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
TRIM21P19474 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
TRIM21P19474 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TRIM21P19474 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TRIM21P19474 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TRIM21P19474 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TRIM21P19474 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
TRIM21P19474 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
TRIM21P19474 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TRIM21P19474 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TRIM21P19474 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TRIM21P19474 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TRIM21P19474 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TRIM21P19474 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TRIM21P19474 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TRIM21P19474 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
TRIM21P19474 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TRIM21P19474 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TRIM21P19474 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TRIM21P19474 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TRIM21P19474 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TRIM21P19474 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TRIM21P19474 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TRIM21P19474 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TRIM21P19474 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TRIM21P19474 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TRIM21P19474 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TRIM21P19474 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TRIM21P19474 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TRIM21P19474 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TRIM21P19474 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TRIM21P19474 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TRIM21P19474 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms