Protein–RNA interactions for Protein: P18146

EGR1, Early growth response protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 543 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EGR1P18146 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
EGR1P18146 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
EGR1P18146 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
EGR1P18146 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
EGR1P18146 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
EGR1P18146 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
EGR1P18146 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
EGR1P18146 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
EGR1P18146 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
EGR1P18146 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
EGR1P18146 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
EGR1P18146 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
EGR1P18146 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
EGR1P18146 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
EGR1P18146 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
EGR1P18146 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
EGR1P18146 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
EGR1P18146 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
EGR1P18146 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
EGR1P18146 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
EGR1P18146 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
EGR1P18146 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
EGR1P18146 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
EGR1P18146 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
EGR1P18146 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
EGR1P18146 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
EGR1P18146 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
EGR1P18146 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
EGR1P18146 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
EGR1P18146 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
EGR1P18146 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
EGR1P18146 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
EGR1P18146 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
EGR1P18146 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
EGR1P18146 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
EGR1P18146 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
EGR1P18146 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
EGR1P18146 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
EGR1P18146 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
EGR1P18146 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
EGR1P18146 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
EGR1P18146 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
EGR1P18146 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
EGR1P18146 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EGR1P18146 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EGR1P18146 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
EGR1P18146 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EGR1P18146 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EGR1P18146 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
EGR1P18146 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EGR1P18146 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
EGR1P18146 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EGR1P18146 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
EGR1P18146 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EGR1P18146 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
EGR1P18146 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EGR1P18146 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
EGR1P18146 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EGR1P18146 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
EGR1P18146 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
EGR1P18146 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EGR1P18146 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
EGR1P18146 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
EGR1P18146 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
EGR1P18146 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
EGR1P18146 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EGR1P18146 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EGR1P18146 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
EGR1P18146 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
EGR1P18146 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EGR1P18146 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EGR1P18146 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EGR1P18146 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EGR1P18146 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EGR1P18146 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EGR1P18146 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
EGR1P18146 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
EGR1P18146 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
EGR1P18146 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EGR1P18146 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EGR1P18146 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EGR1P18146 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EGR1P18146 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EGR1P18146 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EGR1P18146 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EGR1P18146 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EGR1P18146 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
EGR1P18146 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EGR1P18146 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EGR1P18146 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EGR1P18146 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EGR1P18146 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EGR1P18146 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EGR1P18146 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EGR1P18146 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EGR1P18146 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EGR1P18146 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EGR1P18146 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EGR1P18146 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EGR1P18146 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms