Protein–RNA interactions for Protein: P17036

ZNF3, Zinc finger protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 446 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF3P17036 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ZNF3P17036 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ZNF3P17036 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ZNF3P17036 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ZNF3P17036 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
ZNF3P17036 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ZNF3P17036 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ZNF3P17036 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ZNF3P17036 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ZNF3P17036 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ZNF3P17036 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ZNF3P17036 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ZNF3P17036 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ZNF3P17036 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ZNF3P17036 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ZNF3P17036 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
ZNF3P17036 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ZNF3P17036 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ZNF3P17036 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ZNF3P17036 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ZNF3P17036 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
ZNF3P17036 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ZNF3P17036 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ZNF3P17036 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ZNF3P17036 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ZNF3P17036 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ZNF3P17036 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ZNF3P17036 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ZNF3P17036 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ZNF3P17036 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ZNF3P17036 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ZNF3P17036 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ZNF3P17036 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ZNF3P17036 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ZNF3P17036 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ZNF3P17036 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ZNF3P17036 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ZNF3P17036 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ZNF3P17036 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ZNF3P17036 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ZNF3P17036 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ZNF3P17036 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNF3P17036 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNF3P17036 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNF3P17036 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNF3P17036 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNF3P17036 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNF3P17036 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNF3P17036 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNF3P17036 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNF3P17036 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNF3P17036 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNF3P17036 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNF3P17036 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNF3P17036 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNF3P17036 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNF3P17036 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNF3P17036 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNF3P17036 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNF3P17036 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNF3P17036 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNF3P17036 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNF3P17036 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNF3P17036 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNF3P17036 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNF3P17036 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNF3P17036 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNF3P17036 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNF3P17036 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNF3P17036 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNF3P17036 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNF3P17036 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNF3P17036 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF3P17036 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF3P17036 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF3P17036 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF3P17036 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF3P17036 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF3P17036 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF3P17036 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF3P17036 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF3P17036 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF3P17036 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF3P17036 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF3P17036 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF3P17036 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF3P17036 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF3P17036 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF3P17036 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF3P17036 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF3P17036 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF3P17036 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF3P17036 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF3P17036 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF3P17036 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF3P17036 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF3P17036 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF3P17036 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF3P17036 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF3P17036 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms