Protein–RNA interactions for Protein: P10589

NR2F1, COUP transcription factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 423 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR2F1P10589 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
NR2F1P10589 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC17■□□□□ 0.31
NR2F1P10589 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
NR2F1P10589 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
NR2F1P10589 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NR2F1P10589 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NR2F1P10589 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NR2F1P10589 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NR2F1P10589 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NR2F1P10589 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NR2F1P10589 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
NR2F1P10589 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NR2F1P10589 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NR2F1P10589 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NR2F1P10589 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
NR2F1P10589 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NR2F1P10589 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NR2F1P10589 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NR2F1P10589 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NR2F1P10589 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NR2F1P10589 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NR2F1P10589 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NR2F1P10589 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NR2F1P10589 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NR2F1P10589 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
NR2F1P10589 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
NR2F1P10589 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NR2F1P10589 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NR2F1P10589 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NR2F1P10589 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NR2F1P10589 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NR2F1P10589 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NR2F1P10589 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NR2F1P10589 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NR2F1P10589 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NR2F1P10589 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NR2F1P10589 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NR2F1P10589 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NR2F1P10589 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NR2F1P10589 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NR2F1P10589 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NR2F1P10589 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NR2F1P10589 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NR2F1P10589 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NR2F1P10589 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NR2F1P10589 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NR2F1P10589 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NR2F1P10589 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NR2F1P10589 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NR2F1P10589 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NR2F1P10589 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NR2F1P10589 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NR2F1P10589 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NR2F1P10589 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NR2F1P10589 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NR2F1P10589 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NR2F1P10589 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NR2F1P10589 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NR2F1P10589 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NR2F1P10589 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NR2F1P10589 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NR2F1P10589 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NR2F1P10589 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NR2F1P10589 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NR2F1P10589 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NR2F1P10589 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NR2F1P10589 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NR2F1P10589 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
NR2F1P10589 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NR2F1P10589 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NR2F1P10589 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NR2F1P10589 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NR2F1P10589 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NR2F1P10589 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NR2F1P10589 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NR2F1P10589 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NR2F1P10589 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NR2F1P10589 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NR2F1P10589 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NR2F1P10589 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NR2F1P10589 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NR2F1P10589 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NR2F1P10589 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NR2F1P10589 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NR2F1P10589 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NR2F1P10589 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NR2F1P10589 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NR2F1P10589 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NR2F1P10589 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
NR2F1P10589 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NR2F1P10589 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NR2F1P10589 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NR2F1P10589 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
NR2F1P10589 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NR2F1P10589 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NR2F1P10589 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NR2F1P10589 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NR2F1P10589 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NR2F1P10589 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NR2F1P10589 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.2 ms