Protein–RNA interactions for Protein: P09629

HOXB7, Homeobox protein Hox-B7, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB7P09629 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HOXB7P09629 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
HOXB7P09629 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
HOXB7P09629 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HOXB7P09629 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HOXB7P09629 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HOXB7P09629 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HOXB7P09629 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HOXB7P09629 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HOXB7P09629 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HOXB7P09629 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HOXB7P09629 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HOXB7P09629 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HOXB7P09629 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HOXB7P09629 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HOXB7P09629 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HOXB7P09629 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HOXB7P09629 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HOXB7P09629 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HOXB7P09629 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
HOXB7P09629 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
HOXB7P09629 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
HOXB7P09629 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
HOXB7P09629 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
HOXB7P09629 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
HOXB7P09629 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
HOXB7P09629 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
HOXB7P09629 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
HOXB7P09629 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC22.95■■□□□ 1.26
HOXB7P09629 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
HOXB7P09629 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
HOXB7P09629 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
HOXB7P09629 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
HOXB7P09629 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
HOXB7P09629 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC22.94■■□□□ 1.26
HOXB7P09629 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HOXB7P09629 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HOXB7P09629 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HOXB7P09629 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
HOXB7P09629 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
HOXB7P09629 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
HOXB7P09629 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HOXB7P09629 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
HOXB7P09629 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
HOXB7P09629 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
HOXB7P09629 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
HOXB7P09629 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
HOXB7P09629 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
HOXB7P09629 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HOXB7P09629 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
HOXB7P09629 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HOXB7P09629 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
HOXB7P09629 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
HOXB7P09629 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
HOXB7P09629 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HOXB7P09629 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
HOXB7P09629 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
HOXB7P09629 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HOXB7P09629 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
HOXB7P09629 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
HOXB7P09629 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
HOXB7P09629 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
HOXB7P09629 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
HOXB7P09629 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HOXB7P09629 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
HOXB7P09629 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
HOXB7P09629 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
HOXB7P09629 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
HOXB7P09629 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HOXB7P09629 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
HOXB7P09629 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
HOXB7P09629 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HOXB7P09629 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
HOXB7P09629 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HOXB7P09629 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HOXB7P09629 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
HOXB7P09629 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
HOXB7P09629 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HOXB7P09629 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HOXB7P09629 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
HOXB7P09629 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
HOXB7P09629 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
HOXB7P09629 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
HOXB7P09629 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
HOXB7P09629 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
HOXB7P09629 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
HOXB7P09629 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
HOXB7P09629 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
HOXB7P09629 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HOXB7P09629 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HOXB7P09629 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HOXB7P09629 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HOXB7P09629 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
HOXB7P09629 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HOXB7P09629 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HOXB7P09629 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
HOXB7P09629 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
HOXB7P09629 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
HOXB7P09629 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HOXB7P09629 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms