Protein–RNA interactions for Protein: P08238

HSP90AB1, Heat shock protein HSP 90-beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 724 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSP90AB1P08238 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
HSP90AB1P08238 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC23.77■■□□□ 1.4
HSP90AB1P08238 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
HSP90AB1P08238 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC23.77■■□□□ 1.4
HSP90AB1P08238 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
HSP90AB1P08238 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
HSP90AB1P08238 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
HSP90AB1P08238 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
HSP90AB1P08238 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
HSP90AB1P08238 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
HSP90AB1P08238 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
HSP90AB1P08238 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
HSP90AB1P08238 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
HSP90AB1P08238 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.39
HSP90AB1P08238 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
HSP90AB1P08238 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
HSP90AB1P08238 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
HSP90AB1P08238 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
HSP90AB1P08238 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
HSP90AB1P08238 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
HSP90AB1P08238 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
HSP90AB1P08238 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
HSP90AB1P08238 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
HSP90AB1P08238 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
HSP90AB1P08238 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
HSP90AB1P08238 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
HSP90AB1P08238 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
HSP90AB1P08238 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
HSP90AB1P08238 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
HSP90AB1P08238 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
HSP90AB1P08238 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
HSP90AB1P08238 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
HSP90AB1P08238 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
HSP90AB1P08238 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
HSP90AB1P08238 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
HSP90AB1P08238 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
HSP90AB1P08238 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
HSP90AB1P08238 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
HSP90AB1P08238 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
HSP90AB1P08238 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
HSP90AB1P08238 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
HSP90AB1P08238 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
HSP90AB1P08238 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
HSP90AB1P08238 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
HSP90AB1P08238 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
HSP90AB1P08238 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
HSP90AB1P08238 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
HSP90AB1P08238 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
HSP90AB1P08238 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
HSP90AB1P08238 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
HSP90AB1P08238 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
HSP90AB1P08238 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
HSP90AB1P08238 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
HSP90AB1P08238 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
HSP90AB1P08238 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
HSP90AB1P08238 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
HSP90AB1P08238 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
HSP90AB1P08238 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
HSP90AB1P08238 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
HSP90AB1P08238 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
HSP90AB1P08238 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
HSP90AB1P08238 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
HSP90AB1P08238 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
HSP90AB1P08238 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
HSP90AB1P08238 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
HSP90AB1P08238 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
HSP90AB1P08238 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
HSP90AB1P08238 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
HSP90AB1P08238 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
HSP90AB1P08238 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
HSP90AB1P08238 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
HSP90AB1P08238 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
HSP90AB1P08238 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
HSP90AB1P08238 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
HSP90AB1P08238 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
HSP90AB1P08238 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
HSP90AB1P08238 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
HSP90AB1P08238 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
HSP90AB1P08238 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
HSP90AB1P08238 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
HSP90AB1P08238 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
HSP90AB1P08238 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
HSP90AB1P08238 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
HSP90AB1P08238 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
HSP90AB1P08238 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
HSP90AB1P08238 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
HSP90AB1P08238 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
HSP90AB1P08238 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
HSP90AB1P08238 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
HSP90AB1P08238 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
HSP90AB1P08238 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
HSP90AB1P08238 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
HSP90AB1P08238 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
HSP90AB1P08238 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
HSP90AB1P08238 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
HSP90AB1P08238 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
HSP90AB1P08238 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
HSP90AB1P08238 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
HSP90AB1P08238 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
HSP90AB1P08238 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms