Protein–RNA interactions for Protein: P02647

APOA1, Apolipoprotein A-I, humanhuman

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOA1P02647 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
APOA1P02647 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
APOA1P02647 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
APOA1P02647 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
APOA1P02647 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
APOA1P02647 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
APOA1P02647 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
APOA1P02647 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
APOA1P02647 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
APOA1P02647 E2F3-201ENST00000346618 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
APOA1P02647 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
APOA1P02647 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
APOA1P02647 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
APOA1P02647 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
APOA1P02647 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
APOA1P02647 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
APOA1P02647 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
APOA1P02647 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
APOA1P02647 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
APOA1P02647 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
APOA1P02647 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
APOA1P02647 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
APOA1P02647 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
APOA1P02647 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
APOA1P02647 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
APOA1P02647 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
APOA1P02647 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
APOA1P02647 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
APOA1P02647 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
APOA1P02647 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
APOA1P02647 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
APOA1P02647 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
APOA1P02647 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
APOA1P02647 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
APOA1P02647 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
APOA1P02647 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
APOA1P02647 AC021683.3-202ENST00000592572 4440 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
APOA1P02647 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
APOA1P02647 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
APOA1P02647 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
APOA1P02647 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
APOA1P02647 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
APOA1P02647 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
APOA1P02647 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
APOA1P02647 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
APOA1P02647 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
APOA1P02647 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
APOA1P02647 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
APOA1P02647 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
APOA1P02647 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
APOA1P02647 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
APOA1P02647 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
APOA1P02647 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
APOA1P02647 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
APOA1P02647 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
APOA1P02647 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
APOA1P02647 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
APOA1P02647 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
APOA1P02647 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
APOA1P02647 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
APOA1P02647 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
APOA1P02647 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
APOA1P02647 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
APOA1P02647 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
APOA1P02647 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
APOA1P02647 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
APOA1P02647 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
APOA1P02647 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
APOA1P02647 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
APOA1P02647 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
APOA1P02647 TRIM71-201ENST00000383763 8685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
APOA1P02647 SMARCA2-203ENST00000349721 5761 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
APOA1P02647 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
APOA1P02647 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
APOA1P02647 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
APOA1P02647 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
APOA1P02647 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
APOA1P02647 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
APOA1P02647 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
APOA1P02647 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
APOA1P02647 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
APOA1P02647 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
APOA1P02647 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
APOA1P02647 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
APOA1P02647 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
APOA1P02647 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
APOA1P02647 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
APOA1P02647 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
APOA1P02647 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
APOA1P02647 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
APOA1P02647 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
APOA1P02647 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
APOA1P02647 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
APOA1P02647 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
APOA1P02647 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
APOA1P02647 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
APOA1P02647 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
APOA1P02647 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
APOA1P02647 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
APOA1P02647 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms