Protein–RNA interactions for Protein: O95786

DDX58, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX58, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 925 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX58O95786 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
DDX58O95786 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
DDX58O95786 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
DDX58O95786 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
DDX58O95786 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
DDX58O95786 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
DDX58O95786 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
DDX58O95786 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
DDX58O95786 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
DDX58O95786 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
DDX58O95786 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
DDX58O95786 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
DDX58O95786 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
DDX58O95786 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
DDX58O95786 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
DDX58O95786 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
DDX58O95786 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
DDX58O95786 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
DDX58O95786 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
DDX58O95786 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
DDX58O95786 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
DDX58O95786 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
DDX58O95786 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
DDX58O95786 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
DDX58O95786 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
DDX58O95786 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
DDX58O95786 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
DDX58O95786 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
DDX58O95786 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
DDX58O95786 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
DDX58O95786 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
DDX58O95786 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
DDX58O95786 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
DDX58O95786 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
DDX58O95786 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
DDX58O95786 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
DDX58O95786 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
DDX58O95786 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
DDX58O95786 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
DDX58O95786 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
DDX58O95786 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
DDX58O95786 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
DDX58O95786 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
DDX58O95786 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
DDX58O95786 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
DDX58O95786 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
DDX58O95786 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
DDX58O95786 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
DDX58O95786 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
DDX58O95786 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
DDX58O95786 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
DDX58O95786 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
DDX58O95786 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
DDX58O95786 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
DDX58O95786 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
DDX58O95786 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
DDX58O95786 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
DDX58O95786 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
DDX58O95786 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
DDX58O95786 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
DDX58O95786 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
DDX58O95786 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
DDX58O95786 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
DDX58O95786 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
DDX58O95786 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
DDX58O95786 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
DDX58O95786 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
DDX58O95786 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
DDX58O95786 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
DDX58O95786 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
DDX58O95786 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
DDX58O95786 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
DDX58O95786 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
DDX58O95786 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
DDX58O95786 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
DDX58O95786 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
DDX58O95786 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
DDX58O95786 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
DDX58O95786 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
DDX58O95786 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
DDX58O95786 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
DDX58O95786 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
DDX58O95786 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
DDX58O95786 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
DDX58O95786 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
DDX58O95786 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
DDX58O95786 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
DDX58O95786 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
DDX58O95786 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
DDX58O95786 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
DDX58O95786 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
DDX58O95786 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
DDX58O95786 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
DDX58O95786 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
DDX58O95786 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
DDX58O95786 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
DDX58O95786 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
DDX58O95786 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
DDX58O95786 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
DDX58O95786 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.3 ms