Protein–RNA interactions for Protein: O95503

CBX6, Chromobox protein homolog 6, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX6O95503 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CBX6O95503 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CBX6O95503 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CBX6O95503 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CBX6O95503 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CBX6O95503 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
CBX6O95503 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CBX6O95503 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CBX6O95503 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CBX6O95503 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CBX6O95503 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CBX6O95503 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CBX6O95503 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CBX6O95503 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
CBX6O95503 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CBX6O95503 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CBX6O95503 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CBX6O95503 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CBX6O95503 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CBX6O95503 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CBX6O95503 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
CBX6O95503 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CBX6O95503 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CBX6O95503 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CBX6O95503 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CBX6O95503 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CBX6O95503 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CBX6O95503 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CBX6O95503 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CBX6O95503 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CBX6O95503 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CBX6O95503 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
CBX6O95503 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CBX6O95503 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CBX6O95503 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CBX6O95503 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CBX6O95503 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CBX6O95503 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CBX6O95503 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CBX6O95503 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CBX6O95503 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CBX6O95503 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CBX6O95503 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CBX6O95503 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CBX6O95503 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CBX6O95503 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CBX6O95503 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CBX6O95503 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CBX6O95503 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CBX6O95503 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CBX6O95503 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CBX6O95503 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CBX6O95503 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CBX6O95503 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CBX6O95503 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CBX6O95503 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CBX6O95503 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CBX6O95503 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CBX6O95503 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CBX6O95503 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CBX6O95503 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CBX6O95503 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CBX6O95503 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CBX6O95503 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CBX6O95503 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CBX6O95503 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CBX6O95503 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CBX6O95503 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CBX6O95503 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CBX6O95503 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CBX6O95503 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CBX6O95503 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CBX6O95503 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CBX6O95503 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CBX6O95503 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CBX6O95503 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CBX6O95503 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CBX6O95503 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CBX6O95503 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CBX6O95503 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CBX6O95503 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CBX6O95503 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CBX6O95503 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CBX6O95503 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CBX6O95503 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CBX6O95503 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CBX6O95503 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CBX6O95503 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CBX6O95503 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CBX6O95503 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CBX6O95503 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CBX6O95503 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CBX6O95503 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CBX6O95503 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CBX6O95503 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CBX6O95503 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CBX6O95503 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CBX6O95503 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CBX6O95503 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CBX6O95503 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms