Protein–RNA interactions for Protein: O95343

SIX3, Homeobox protein SIX3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIX3O95343 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SIX3O95343 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SIX3O95343 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SIX3O95343 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
SIX3O95343 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SIX3O95343 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SIX3O95343 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SIX3O95343 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SIX3O95343 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SIX3O95343 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SIX3O95343 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
SIX3O95343 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SIX3O95343 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SIX3O95343 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
SIX3O95343 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SIX3O95343 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SIX3O95343 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SIX3O95343 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SIX3O95343 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SIX3O95343 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SIX3O95343 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SIX3O95343 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SIX3O95343 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SIX3O95343 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
SIX3O95343 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SIX3O95343 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SIX3O95343 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SIX3O95343 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SIX3O95343 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SIX3O95343 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SIX3O95343 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SIX3O95343 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SIX3O95343 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SIX3O95343 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SIX3O95343 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SIX3O95343 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SIX3O95343 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SIX3O95343 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SIX3O95343 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SIX3O95343 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SIX3O95343 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SIX3O95343 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SIX3O95343 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SIX3O95343 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SIX3O95343 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SIX3O95343 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SIX3O95343 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SIX3O95343 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SIX3O95343 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SIX3O95343 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SIX3O95343 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SIX3O95343 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SIX3O95343 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SIX3O95343 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SIX3O95343 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SIX3O95343 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SIX3O95343 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SIX3O95343 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SIX3O95343 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SIX3O95343 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SIX3O95343 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SIX3O95343 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SIX3O95343 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SIX3O95343 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SIX3O95343 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SIX3O95343 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
SIX3O95343 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SIX3O95343 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SIX3O95343 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SIX3O95343 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SIX3O95343 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SIX3O95343 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SIX3O95343 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SIX3O95343 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SIX3O95343 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SIX3O95343 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SIX3O95343 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SIX3O95343 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SIX3O95343 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SIX3O95343 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SIX3O95343 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SIX3O95343 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SIX3O95343 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SIX3O95343 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SIX3O95343 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SIX3O95343 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SIX3O95343 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SIX3O95343 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SIX3O95343 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SIX3O95343 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SIX3O95343 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SIX3O95343 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SIX3O95343 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SIX3O95343 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SIX3O95343 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SIX3O95343 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SIX3O95343 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SIX3O95343 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SIX3O95343 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SIX3O95343 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms