Protein–RNA interactions for Protein: O75936

BBOX1, Gamma-butyrobetaine dioxygenase, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BBOX1O75936 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
BBOX1O75936 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
BBOX1O75936 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
BBOX1O75936 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
BBOX1O75936 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
BBOX1O75936 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
BBOX1O75936 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
BBOX1O75936 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
BBOX1O75936 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
BBOX1O75936 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
BBOX1O75936 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
BBOX1O75936 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
BBOX1O75936 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
BBOX1O75936 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
BBOX1O75936 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
BBOX1O75936 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
BBOX1O75936 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
BBOX1O75936 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
BBOX1O75936 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
BBOX1O75936 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
BBOX1O75936 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
BBOX1O75936 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
BBOX1O75936 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
BBOX1O75936 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
BBOX1O75936 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
BBOX1O75936 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
BBOX1O75936 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
BBOX1O75936 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
BBOX1O75936 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
BBOX1O75936 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
BBOX1O75936 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
BBOX1O75936 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
BBOX1O75936 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
BBOX1O75936 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
BBOX1O75936 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
BBOX1O75936 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
BBOX1O75936 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
BBOX1O75936 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
BBOX1O75936 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
BBOX1O75936 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
BBOX1O75936 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
BBOX1O75936 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
BBOX1O75936 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
BBOX1O75936 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
BBOX1O75936 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
BBOX1O75936 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
BBOX1O75936 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
BBOX1O75936 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
BBOX1O75936 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
BBOX1O75936 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
BBOX1O75936 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
BBOX1O75936 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
BBOX1O75936 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
BBOX1O75936 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
BBOX1O75936 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
BBOX1O75936 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
BBOX1O75936 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
BBOX1O75936 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC22■■□□□ 1.11
BBOX1O75936 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
BBOX1O75936 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
BBOX1O75936 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
BBOX1O75936 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC22■■□□□ 1.11
BBOX1O75936 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
BBOX1O75936 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
BBOX1O75936 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
BBOX1O75936 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
BBOX1O75936 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
BBOX1O75936 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
BBOX1O75936 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
BBOX1O75936 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
BBOX1O75936 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
BBOX1O75936 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
BBOX1O75936 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
BBOX1O75936 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC22■■□□□ 1.11
BBOX1O75936 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC22■■□□□ 1.11
BBOX1O75936 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
BBOX1O75936 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
BBOX1O75936 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
BBOX1O75936 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
BBOX1O75936 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
BBOX1O75936 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
BBOX1O75936 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
BBOX1O75936 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
BBOX1O75936 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
BBOX1O75936 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
BBOX1O75936 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
BBOX1O75936 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
BBOX1O75936 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
BBOX1O75936 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
BBOX1O75936 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
BBOX1O75936 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
BBOX1O75936 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
BBOX1O75936 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
BBOX1O75936 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
BBOX1O75936 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
BBOX1O75936 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
BBOX1O75936 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
BBOX1O75936 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
BBOX1O75936 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
BBOX1O75936 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms