Protein–RNA interactions for Protein: O75676

RPS6KA4, Ribosomal protein S6 kinase alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 772 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS6KA4O75676 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RPS6KA4O75676 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RPS6KA4O75676 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
RPS6KA4O75676 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RPS6KA4O75676 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RPS6KA4O75676 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RPS6KA4O75676 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RPS6KA4O75676 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RPS6KA4O75676 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RPS6KA4O75676 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RPS6KA4O75676 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RPS6KA4O75676 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RPS6KA4O75676 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RPS6KA4O75676 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RPS6KA4O75676 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RPS6KA4O75676 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RPS6KA4O75676 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RPS6KA4O75676 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RPS6KA4O75676 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RPS6KA4O75676 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RPS6KA4O75676 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RPS6KA4O75676 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RPS6KA4O75676 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RPS6KA4O75676 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RPS6KA4O75676 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RPS6KA4O75676 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RPS6KA4O75676 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RPS6KA4O75676 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RPS6KA4O75676 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RPS6KA4O75676 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RPS6KA4O75676 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RPS6KA4O75676 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RPS6KA4O75676 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RPS6KA4O75676 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RPS6KA4O75676 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RPS6KA4O75676 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RPS6KA4O75676 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RPS6KA4O75676 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RPS6KA4O75676 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RPS6KA4O75676 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RPS6KA4O75676 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RPS6KA4O75676 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RPS6KA4O75676 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RPS6KA4O75676 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RPS6KA4O75676 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RPS6KA4O75676 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RPS6KA4O75676 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RPS6KA4O75676 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RPS6KA4O75676 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RPS6KA4O75676 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RPS6KA4O75676 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RPS6KA4O75676 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RPS6KA4O75676 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RPS6KA4O75676 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RPS6KA4O75676 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RPS6KA4O75676 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RPS6KA4O75676 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RPS6KA4O75676 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RPS6KA4O75676 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RPS6KA4O75676 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RPS6KA4O75676 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RPS6KA4O75676 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RPS6KA4O75676 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RPS6KA4O75676 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RPS6KA4O75676 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RPS6KA4O75676 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
RPS6KA4O75676 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RPS6KA4O75676 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RPS6KA4O75676 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RPS6KA4O75676 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
RPS6KA4O75676 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RPS6KA4O75676 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RPS6KA4O75676 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RPS6KA4O75676 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RPS6KA4O75676 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RPS6KA4O75676 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RPS6KA4O75676 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RPS6KA4O75676 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RPS6KA4O75676 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RPS6KA4O75676 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RPS6KA4O75676 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RPS6KA4O75676 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RPS6KA4O75676 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RPS6KA4O75676 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RPS6KA4O75676 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
RPS6KA4O75676 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RPS6KA4O75676 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
RPS6KA4O75676 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RPS6KA4O75676 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RPS6KA4O75676 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RPS6KA4O75676 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RPS6KA4O75676 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RPS6KA4O75676 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RPS6KA4O75676 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RPS6KA4O75676 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RPS6KA4O75676 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
RPS6KA4O75676 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RPS6KA4O75676 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RPS6KA4O75676 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RPS6KA4O75676 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.7 ms