Protein–RNA interactions for Protein: O60931

CTNS, Cystinosin, humanhuman

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNSO60931 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CTNSO60931 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CTNSO60931 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CTNSO60931 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CTNSO60931 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CTNSO60931 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CTNSO60931 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CTNSO60931 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CTNSO60931 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CTNSO60931 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CTNSO60931 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CTNSO60931 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CTNSO60931 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CTNSO60931 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CTNSO60931 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CTNSO60931 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CTNSO60931 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CTNSO60931 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CTNSO60931 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CTNSO60931 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CTNSO60931 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CTNSO60931 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CTNSO60931 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
CTNSO60931 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CTNSO60931 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CTNSO60931 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CTNSO60931 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CTNSO60931 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CTNSO60931 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CTNSO60931 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CTNSO60931 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CTNSO60931 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CTNSO60931 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CTNSO60931 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CTNSO60931 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CTNSO60931 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CTNSO60931 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CTNSO60931 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CTNSO60931 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CTNSO60931 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
CTNSO60931 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CTNSO60931 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CTNSO60931 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
CTNSO60931 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CTNSO60931 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
CTNSO60931 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
CTNSO60931 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
CTNSO60931 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CTNSO60931 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CTNSO60931 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CTNSO60931 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CTNSO60931 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CTNSO60931 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CTNSO60931 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CTNSO60931 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
CTNSO60931 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CTNSO60931 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CTNSO60931 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CTNSO60931 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CTNSO60931 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CTNSO60931 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CTNSO60931 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CTNSO60931 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CTNSO60931 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CTNSO60931 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CTNSO60931 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CTNSO60931 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CTNSO60931 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CTNSO60931 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CTNSO60931 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CTNSO60931 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
CTNSO60931 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CTNSO60931 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CTNSO60931 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CTNSO60931 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CTNSO60931 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CTNSO60931 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CTNSO60931 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CTNSO60931 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CTNSO60931 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CTNSO60931 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CTNSO60931 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CTNSO60931 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CTNSO60931 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CTNSO60931 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CTNSO60931 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CTNSO60931 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CTNSO60931 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
CTNSO60931 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
CTNSO60931 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
CTNSO60931 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
CTNSO60931 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
CTNSO60931 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
CTNSO60931 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
CTNSO60931 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CTNSO60931 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
CTNSO60931 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CTNSO60931 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CTNSO60931 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CTNSO60931 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms