Protein–RNA interactions for Protein: O60238

BNIP3L, BCL2/adenovirus E1B 19 kDa protein-interacting protein 3-like, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNIP3LO60238 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
BNIP3LO60238 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
BNIP3LO60238 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
BNIP3LO60238 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
BNIP3LO60238 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
BNIP3LO60238 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
BNIP3LO60238 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
BNIP3LO60238 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
BNIP3LO60238 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
BNIP3LO60238 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
BNIP3LO60238 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
BNIP3LO60238 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
BNIP3LO60238 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
BNIP3LO60238 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
BNIP3LO60238 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
BNIP3LO60238 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
BNIP3LO60238 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
BNIP3LO60238 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
BNIP3LO60238 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
BNIP3LO60238 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
BNIP3LO60238 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
BNIP3LO60238 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
BNIP3LO60238 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
BNIP3LO60238 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
BNIP3LO60238 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
BNIP3LO60238 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
BNIP3LO60238 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
BNIP3LO60238 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
BNIP3LO60238 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
BNIP3LO60238 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
BNIP3LO60238 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
BNIP3LO60238 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
BNIP3LO60238 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
BNIP3LO60238 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
BNIP3LO60238 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
BNIP3LO60238 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
BNIP3LO60238 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
BNIP3LO60238 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
BNIP3LO60238 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
BNIP3LO60238 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
BNIP3LO60238 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
BNIP3LO60238 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
BNIP3LO60238 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
BNIP3LO60238 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
BNIP3LO60238 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
BNIP3LO60238 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
BNIP3LO60238 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
BNIP3LO60238 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
BNIP3LO60238 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
BNIP3LO60238 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
BNIP3LO60238 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
BNIP3LO60238 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
BNIP3LO60238 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
BNIP3LO60238 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
BNIP3LO60238 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
BNIP3LO60238 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
BNIP3LO60238 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
BNIP3LO60238 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
BNIP3LO60238 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
BNIP3LO60238 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
BNIP3LO60238 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
BNIP3LO60238 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
BNIP3LO60238 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
BNIP3LO60238 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
BNIP3LO60238 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
BNIP3LO60238 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
BNIP3LO60238 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
BNIP3LO60238 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
BNIP3LO60238 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
BNIP3LO60238 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
BNIP3LO60238 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
BNIP3LO60238 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
BNIP3LO60238 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
BNIP3LO60238 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
BNIP3LO60238 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
BNIP3LO60238 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
BNIP3LO60238 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
BNIP3LO60238 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
BNIP3LO60238 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
BNIP3LO60238 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
BNIP3LO60238 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
BNIP3LO60238 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
BNIP3LO60238 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
BNIP3LO60238 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
BNIP3LO60238 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
BNIP3LO60238 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
BNIP3LO60238 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
BNIP3LO60238 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
BNIP3LO60238 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
BNIP3LO60238 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
BNIP3LO60238 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
BNIP3LO60238 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
BNIP3LO60238 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
BNIP3LO60238 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
BNIP3LO60238 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
BNIP3LO60238 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
BNIP3LO60238 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
BNIP3LO60238 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
BNIP3LO60238 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
BNIP3LO60238 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.7 ms