Protein–RNA interactions for Protein: O43854

EDIL3, EGF-like repeat and discoidin I-like domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDIL3O43854 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
EDIL3O43854 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
EDIL3O43854 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
EDIL3O43854 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
EDIL3O43854 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
EDIL3O43854 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
EDIL3O43854 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
EDIL3O43854 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
EDIL3O43854 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
EDIL3O43854 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
EDIL3O43854 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
EDIL3O43854 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
EDIL3O43854 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
EDIL3O43854 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
EDIL3O43854 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
EDIL3O43854 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
EDIL3O43854 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
EDIL3O43854 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
EDIL3O43854 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
EDIL3O43854 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
EDIL3O43854 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
EDIL3O43854 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
EDIL3O43854 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
EDIL3O43854 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
EDIL3O43854 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
EDIL3O43854 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
EDIL3O43854 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
EDIL3O43854 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
EDIL3O43854 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
EDIL3O43854 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
EDIL3O43854 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
EDIL3O43854 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
EDIL3O43854 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
EDIL3O43854 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
EDIL3O43854 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
EDIL3O43854 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
EDIL3O43854 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
EDIL3O43854 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
EDIL3O43854 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
EDIL3O43854 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
EDIL3O43854 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
EDIL3O43854 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
EDIL3O43854 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
EDIL3O43854 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC20.36■□□□□ 0.85
EDIL3O43854 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
EDIL3O43854 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
EDIL3O43854 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
EDIL3O43854 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
EDIL3O43854 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
EDIL3O43854 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
EDIL3O43854 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
EDIL3O43854 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
EDIL3O43854 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
EDIL3O43854 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
EDIL3O43854 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
EDIL3O43854 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
EDIL3O43854 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
EDIL3O43854 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
EDIL3O43854 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
EDIL3O43854 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
EDIL3O43854 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
EDIL3O43854 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
EDIL3O43854 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
EDIL3O43854 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
EDIL3O43854 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
EDIL3O43854 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
EDIL3O43854 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
EDIL3O43854 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
EDIL3O43854 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
EDIL3O43854 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
EDIL3O43854 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
EDIL3O43854 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
EDIL3O43854 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
EDIL3O43854 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
EDIL3O43854 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
EDIL3O43854 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
EDIL3O43854 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
EDIL3O43854 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
EDIL3O43854 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
EDIL3O43854 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
EDIL3O43854 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
EDIL3O43854 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
EDIL3O43854 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
EDIL3O43854 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
EDIL3O43854 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
EDIL3O43854 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
EDIL3O43854 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
EDIL3O43854 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
EDIL3O43854 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
EDIL3O43854 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
EDIL3O43854 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
EDIL3O43854 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
EDIL3O43854 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
EDIL3O43854 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
EDIL3O43854 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
EDIL3O43854 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
EDIL3O43854 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
EDIL3O43854 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
EDIL3O43854 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
EDIL3O43854 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms