Protein–RNA interactions for Protein: O43246

SLC7A4, Cationic amino acid transporter 4, humanhuman

Predictions only

Length 635 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC7A4O43246 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC7A4O43246 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC7A4O43246 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC7A4O43246 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC7A4O43246 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC7A4O43246 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC7A4O43246 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC7A4O43246 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC7A4O43246 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC7A4O43246 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC7A4O43246 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC7A4O43246 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC7A4O43246 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC7A4O43246 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC7A4O43246 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC7A4O43246 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC7A4O43246 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC7A4O43246 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC7A4O43246 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC7A4O43246 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC7A4O43246 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC7A4O43246 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC7A4O43246 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC7A4O43246 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC7A4O43246 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC7A4O43246 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC7A4O43246 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC7A4O43246 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC7A4O43246 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC7A4O43246 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC7A4O43246 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC7A4O43246 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC7A4O43246 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC7A4O43246 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC7A4O43246 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC7A4O43246 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC7A4O43246 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC7A4O43246 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SLC7A4O43246 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SLC7A4O43246 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SLC7A4O43246 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SLC7A4O43246 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SLC7A4O43246 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SLC7A4O43246 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SLC7A4O43246 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SLC7A4O43246 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SLC7A4O43246 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SLC7A4O43246 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SLC7A4O43246 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SLC7A4O43246 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SLC7A4O43246 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
SLC7A4O43246 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
SLC7A4O43246 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SLC7A4O43246 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SLC7A4O43246 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SLC7A4O43246 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SLC7A4O43246 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SLC7A4O43246 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
SLC7A4O43246 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SLC7A4O43246 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SLC7A4O43246 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SLC7A4O43246 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SLC7A4O43246 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SLC7A4O43246 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SLC7A4O43246 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SLC7A4O43246 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SLC7A4O43246 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SLC7A4O43246 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SLC7A4O43246 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SLC7A4O43246 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SLC7A4O43246 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SLC7A4O43246 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SLC7A4O43246 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SLC7A4O43246 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SLC7A4O43246 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
SLC7A4O43246 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SLC7A4O43246 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SLC7A4O43246 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SLC7A4O43246 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SLC7A4O43246 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SLC7A4O43246 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SLC7A4O43246 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SLC7A4O43246 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SLC7A4O43246 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SLC7A4O43246 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SLC7A4O43246 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SLC7A4O43246 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
SLC7A4O43246 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SLC7A4O43246 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SLC7A4O43246 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SLC7A4O43246 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SLC7A4O43246 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
SLC7A4O43246 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SLC7A4O43246 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SLC7A4O43246 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SLC7A4O43246 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SLC7A4O43246 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SLC7A4O43246 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
SLC7A4O43246 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
SLC7A4O43246 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms