Protein–RNA interactions for Protein: O43196

MSH5, MutS protein homolog 5, humanhuman

Predictions only

Length 834 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSH5O43196 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
MSH5O43196 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
MSH5O43196 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
MSH5O43196 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
MSH5O43196 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
MSH5O43196 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
MSH5O43196 RASSF8-216ENST00000615708 1328 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
MSH5O43196 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
MSH5O43196 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
MSH5O43196 DNAJC12-202ENST00000339758 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
MSH5O43196 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
MSH5O43196 MTND4P13-201ENST00000402078 1023 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
MSH5O43196 AC007557.4-201ENST00000421907 430 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
MSH5O43196 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
MSH5O43196 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
MSH5O43196 AP003043.1-201ENST00000527804 547 ntTSL 4 BASIC24.68■■□□□ 1.54
MSH5O43196 ZNF30-AS1-201ENST00000604333 625 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
MSH5O43196 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
MSH5O43196 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
MSH5O43196 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
MSH5O43196 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
MSH5O43196 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
MSH5O43196 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
MSH5O43196 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
MSH5O43196 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
MSH5O43196 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
MSH5O43196 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
MSH5O43196 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
MSH5O43196 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
MSH5O43196 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
MSH5O43196 IL2-201ENST00000226730 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
MSH5O43196 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
MSH5O43196 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
MSH5O43196 TMEM177-203ENST00000409951 1216 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
MSH5O43196 AC092801.1-201ENST00000443763 581 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
MSH5O43196 AC073359.1-201ENST00000486545 521 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
MSH5O43196 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
MSH5O43196 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
MSH5O43196 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
MSH5O43196 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
MSH5O43196 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
MSH5O43196 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
MSH5O43196 PCNA-202ENST00000379160 1359 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
MSH5O43196 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
MSH5O43196 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
MSH5O43196 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
MSH5O43196 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
MSH5O43196 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
MSH5O43196 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
MSH5O43196 PSG5-207ENST00000407568 1064 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
MSH5O43196 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
MSH5O43196 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
MSH5O43196 AC026355.2-201ENST00000456755 723 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
MSH5O43196 LYRM2-204ENST00000520441 791 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
MSH5O43196 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
MSH5O43196 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
MSH5O43196 AP001198.2-201ENST00000593121 466 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
MSH5O43196 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
MSH5O43196 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
MSH5O43196 AC139792.2-201ENST00000624218 587 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
MSH5O43196 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
MSH5O43196 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
MSH5O43196 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
MSH5O43196 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
MSH5O43196 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
MSH5O43196 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
MSH5O43196 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
MSH5O43196 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
MSH5O43196 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
MSH5O43196 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
MSH5O43196 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
MSH5O43196 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
MSH5O43196 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
MSH5O43196 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
MSH5O43196 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
MSH5O43196 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
MSH5O43196 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
MSH5O43196 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
MSH5O43196 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
MSH5O43196 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
MSH5O43196 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
MSH5O43196 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
MSH5O43196 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
MSH5O43196 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
MSH5O43196 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
MSH5O43196 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
MSH5O43196 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
MSH5O43196 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
MSH5O43196 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
MSH5O43196 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
MSH5O43196 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
MSH5O43196 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
MSH5O43196 PMP2-202ENST00000519260 1264 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
MSH5O43196 CD24P2-201ENST00000565486 219 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
MSH5O43196 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
MSH5O43196 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
MSH5O43196 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
MSH5O43196 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
MSH5O43196 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
MSH5O43196 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms