Protein–RNA interactions for Protein: O15084

ANKRD28, Serine/threonine-protein phosphatase 6 regulatory ankyrin repeat subunit A, humanhuman

Predictions only

Length 1,053 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD28O15084 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ANKRD28O15084 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ANKRD28O15084 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ANKRD28O15084 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ANKRD28O15084 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ANKRD28O15084 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ANKRD28O15084 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ANKRD28O15084 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ANKRD28O15084 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ANKRD28O15084 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ANKRD28O15084 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ANKRD28O15084 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ANKRD28O15084 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
ANKRD28O15084 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ANKRD28O15084 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ANKRD28O15084 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ANKRD28O15084 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
ANKRD28O15084 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
ANKRD28O15084 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
ANKRD28O15084 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
ANKRD28O15084 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
ANKRD28O15084 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ANKRD28O15084 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ANKRD28O15084 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ANKRD28O15084 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ANKRD28O15084 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ANKRD28O15084 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
ANKRD28O15084 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ANKRD28O15084 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ANKRD28O15084 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ANKRD28O15084 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ANKRD28O15084 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ANKRD28O15084 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ANKRD28O15084 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ANKRD28O15084 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ANKRD28O15084 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ANKRD28O15084 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ANKRD28O15084 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ANKRD28O15084 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ANKRD28O15084 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ANKRD28O15084 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ANKRD28O15084 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ANKRD28O15084 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
ANKRD28O15084 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
ANKRD28O15084 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
ANKRD28O15084 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ANKRD28O15084 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ANKRD28O15084 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ANKRD28O15084 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ANKRD28O15084 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ANKRD28O15084 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ANKRD28O15084 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ANKRD28O15084 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ANKRD28O15084 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ANKRD28O15084 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ANKRD28O15084 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ANKRD28O15084 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ANKRD28O15084 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ANKRD28O15084 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ANKRD28O15084 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ANKRD28O15084 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ANKRD28O15084 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ANKRD28O15084 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ANKRD28O15084 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ANKRD28O15084 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ANKRD28O15084 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ANKRD28O15084 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ANKRD28O15084 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ANKRD28O15084 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ANKRD28O15084 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ANKRD28O15084 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
ANKRD28O15084 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ANKRD28O15084 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ANKRD28O15084 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ANKRD28O15084 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
ANKRD28O15084 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ANKRD28O15084 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ANKRD28O15084 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ANKRD28O15084 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ANKRD28O15084 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ANKRD28O15084 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ANKRD28O15084 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ANKRD28O15084 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ANKRD28O15084 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ANKRD28O15084 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ANKRD28O15084 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ANKRD28O15084 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ANKRD28O15084 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ANKRD28O15084 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ANKRD28O15084 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ANKRD28O15084 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ANKRD28O15084 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ANKRD28O15084 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ANKRD28O15084 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ANKRD28O15084 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ANKRD28O15084 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ANKRD28O15084 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ANKRD28O15084 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ANKRD28O15084 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ANKRD28O15084 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms