Protein–RNA interactions for Protein: O14522

PTPRT, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, humanhuman

Predictions only

Length 1,441 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRTO14522 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
PTPRTO14522 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
PTPRTO14522 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PTPRTO14522 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
PTPRTO14522 IER3IP1-202ENST00000639845 832 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
PTPRTO14522 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
PTPRTO14522 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
PTPRTO14522 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
PTPRTO14522 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PTPRTO14522 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PTPRTO14522 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
PTPRTO14522 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PTPRTO14522 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
PTPRTO14522 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PTPRTO14522 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
PTPRTO14522 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PTPRTO14522 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
PTPRTO14522 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
PTPRTO14522 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
PTPRTO14522 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
PTPRTO14522 AC136475.3-203ENST00000525217 617 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
PTPRTO14522 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
PTPRTO14522 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
PTPRTO14522 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
PTPRTO14522 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
PTPRTO14522 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
PTPRTO14522 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PTPRTO14522 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PTPRTO14522 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PTPRTO14522 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PTPRTO14522 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PTPRTO14522 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC26.29■■□□□ 1.8
PTPRTO14522 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC26.29■■□□□ 1.8
PTPRTO14522 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
PTPRTO14522 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
PTPRTO14522 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
PTPRTO14522 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
PTPRTO14522 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PTPRTO14522 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
PTPRTO14522 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PTPRTO14522 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PTPRTO14522 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
PTPRTO14522 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PTPRTO14522 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PTPRTO14522 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
PTPRTO14522 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
PTPRTO14522 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PTPRTO14522 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
PTPRTO14522 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PTPRTO14522 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
PTPRTO14522 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
PTPRTO14522 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PTPRTO14522 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
PTPRTO14522 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
PTPRTO14522 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PTPRTO14522 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PTPRTO14522 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PTPRTO14522 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PTPRTO14522 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PTPRTO14522 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
PTPRTO14522 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PTPRTO14522 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PTPRTO14522 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PTPRTO14522 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.8
PTPRTO14522 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PTPRTO14522 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
PTPRTO14522 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PTPRTO14522 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
PTPRTO14522 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
PTPRTO14522 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
PTPRTO14522 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC26.26■■□□□ 1.79
PTPRTO14522 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC26.26■■□□□ 1.79
PTPRTO14522 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
PTPRTO14522 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PTPRTO14522 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
PTPRTO14522 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
PTPRTO14522 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PTPRTO14522 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
PTPRTO14522 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
PTPRTO14522 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PTPRTO14522 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PTPRTO14522 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PTPRTO14522 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
PTPRTO14522 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
PTPRTO14522 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PTPRTO14522 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
PTPRTO14522 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
PTPRTO14522 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
PTPRTO14522 AC007274.1-201ENST00000439805 662 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
PTPRTO14522 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
PTPRTO14522 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
PTPRTO14522 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PTPRTO14522 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
PTPRTO14522 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PTPRTO14522 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
PTPRTO14522 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PTPRTO14522 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
PTPRTO14522 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PTPRTO14522 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
PTPRTO14522 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms