Protein–RNA interactions for Protein: O00716

E2F3, Transcription factor E2F3, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F3O00716 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
E2F3O00716 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
E2F3O00716 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
E2F3O00716 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
E2F3O00716 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
E2F3O00716 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
E2F3O00716 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
E2F3O00716 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
E2F3O00716 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
E2F3O00716 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
E2F3O00716 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
E2F3O00716 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
E2F3O00716 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
E2F3O00716 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
E2F3O00716 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
E2F3O00716 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
E2F3O00716 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
E2F3O00716 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
E2F3O00716 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
E2F3O00716 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
E2F3O00716 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
E2F3O00716 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
E2F3O00716 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
E2F3O00716 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
E2F3O00716 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
E2F3O00716 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
E2F3O00716 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
E2F3O00716 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
E2F3O00716 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
E2F3O00716 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
E2F3O00716 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
E2F3O00716 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
E2F3O00716 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
E2F3O00716 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
E2F3O00716 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
E2F3O00716 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
E2F3O00716 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
E2F3O00716 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
E2F3O00716 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
E2F3O00716 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
E2F3O00716 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
E2F3O00716 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
E2F3O00716 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
E2F3O00716 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
E2F3O00716 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
E2F3O00716 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
E2F3O00716 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
E2F3O00716 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
E2F3O00716 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
E2F3O00716 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
E2F3O00716 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
E2F3O00716 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
E2F3O00716 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
E2F3O00716 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
E2F3O00716 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
E2F3O00716 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
E2F3O00716 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
E2F3O00716 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
E2F3O00716 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
E2F3O00716 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
E2F3O00716 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
E2F3O00716 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
E2F3O00716 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
E2F3O00716 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
E2F3O00716 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
E2F3O00716 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
E2F3O00716 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
E2F3O00716 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
E2F3O00716 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
E2F3O00716 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
E2F3O00716 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
E2F3O00716 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
E2F3O00716 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
E2F3O00716 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
E2F3O00716 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
E2F3O00716 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
E2F3O00716 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
E2F3O00716 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
E2F3O00716 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
E2F3O00716 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
E2F3O00716 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
E2F3O00716 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
E2F3O00716 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
E2F3O00716 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
E2F3O00716 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
E2F3O00716 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
E2F3O00716 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
E2F3O00716 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
E2F3O00716 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
E2F3O00716 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
E2F3O00716 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
E2F3O00716 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
E2F3O00716 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
E2F3O00716 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
E2F3O00716 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
E2F3O00716 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
E2F3O00716 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
E2F3O00716 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
E2F3O00716 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
E2F3O00716 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.8 ms