Protein–RNA interactions for Protein: I3L3R5

CCER2, Coiled-coil domain-containing glutamate-rich protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCER2I3L3R5 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCER2I3L3R5 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCER2I3L3R5 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCER2I3L3R5 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCER2I3L3R5 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCER2I3L3R5 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCER2I3L3R5 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCER2I3L3R5 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCER2I3L3R5 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCER2I3L3R5 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCER2I3L3R5 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCER2I3L3R5 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCER2I3L3R5 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCER2I3L3R5 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
CCER2I3L3R5 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCER2I3L3R5 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCER2I3L3R5 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCER2I3L3R5 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCER2I3L3R5 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCER2I3L3R5 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCER2I3L3R5 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCER2I3L3R5 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCER2I3L3R5 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCER2I3L3R5 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCER2I3L3R5 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCER2I3L3R5 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCER2I3L3R5 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
CCER2I3L3R5 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
CCER2I3L3R5 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCER2I3L3R5 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCER2I3L3R5 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCER2I3L3R5 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCER2I3L3R5 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCER2I3L3R5 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCER2I3L3R5 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCER2I3L3R5 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCER2I3L3R5 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCER2I3L3R5 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCER2I3L3R5 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCER2I3L3R5 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCER2I3L3R5 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCER2I3L3R5 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCER2I3L3R5 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCER2I3L3R5 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
CCER2I3L3R5 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCER2I3L3R5 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCER2I3L3R5 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCER2I3L3R5 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCER2I3L3R5 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
CCER2I3L3R5 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCER2I3L3R5 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
CCER2I3L3R5 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCER2I3L3R5 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCER2I3L3R5 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCER2I3L3R5 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCER2I3L3R5 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCER2I3L3R5 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCER2I3L3R5 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCER2I3L3R5 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCER2I3L3R5 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCER2I3L3R5 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCER2I3L3R5 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCER2I3L3R5 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCER2I3L3R5 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCER2I3L3R5 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCER2I3L3R5 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCER2I3L3R5 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCER2I3L3R5 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCER2I3L3R5 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCER2I3L3R5 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCER2I3L3R5 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCER2I3L3R5 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCER2I3L3R5 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCER2I3L3R5 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCER2I3L3R5 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCER2I3L3R5 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCER2I3L3R5 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCER2I3L3R5 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCER2I3L3R5 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCER2I3L3R5 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCER2I3L3R5 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCER2I3L3R5 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
CCER2I3L3R5 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCER2I3L3R5 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
CCER2I3L3R5 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCER2I3L3R5 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCER2I3L3R5 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCER2I3L3R5 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCER2I3L3R5 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCER2I3L3R5 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCER2I3L3R5 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCER2I3L3R5 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCER2I3L3R5 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCER2I3L3R5 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCER2I3L3R5 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCER2I3L3R5 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCER2I3L3R5 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCER2I3L3R5 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCER2I3L3R5 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCER2I3L3R5 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.6 ms