Protein–RNA interactions for Protein: E9PL57

NEDD8-MDP1, NEDD8-MDP1 readthrough (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8-MDP1E9PL57 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NEDD8-MDP1E9PL57 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NEDD8-MDP1E9PL57 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NEDD8-MDP1E9PL57 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NEDD8-MDP1E9PL57 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NEDD8-MDP1E9PL57 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NEDD8-MDP1E9PL57 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NEDD8-MDP1E9PL57 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NEDD8-MDP1E9PL57 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NEDD8-MDP1E9PL57 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NEDD8-MDP1E9PL57 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NEDD8-MDP1E9PL57 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NEDD8-MDP1E9PL57 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NEDD8-MDP1E9PL57 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NEDD8-MDP1E9PL57 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NEDD8-MDP1E9PL57 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NEDD8-MDP1E9PL57 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NEDD8-MDP1E9PL57 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NEDD8-MDP1E9PL57 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NEDD8-MDP1E9PL57 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NEDD8-MDP1E9PL57 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NEDD8-MDP1E9PL57 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NEDD8-MDP1E9PL57 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NEDD8-MDP1E9PL57 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NEDD8-MDP1E9PL57 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NEDD8-MDP1E9PL57 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NEDD8-MDP1E9PL57 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NEDD8-MDP1E9PL57 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NEDD8-MDP1E9PL57 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NEDD8-MDP1E9PL57 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NEDD8-MDP1E9PL57 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NEDD8-MDP1E9PL57 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NEDD8-MDP1E9PL57 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NEDD8-MDP1E9PL57 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NEDD8-MDP1E9PL57 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
NEDD8-MDP1E9PL57 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NEDD8-MDP1E9PL57 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NEDD8-MDP1E9PL57 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NEDD8-MDP1E9PL57 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NEDD8-MDP1E9PL57 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NEDD8-MDP1E9PL57 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NEDD8-MDP1E9PL57 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NEDD8-MDP1E9PL57 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NEDD8-MDP1E9PL57 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NEDD8-MDP1E9PL57 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NEDD8-MDP1E9PL57 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NEDD8-MDP1E9PL57 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NEDD8-MDP1E9PL57 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NEDD8-MDP1E9PL57 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NEDD8-MDP1E9PL57 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NEDD8-MDP1E9PL57 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NEDD8-MDP1E9PL57 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NEDD8-MDP1E9PL57 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NEDD8-MDP1E9PL57 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NEDD8-MDP1E9PL57 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NEDD8-MDP1E9PL57 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NEDD8-MDP1E9PL57 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NEDD8-MDP1E9PL57 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NEDD8-MDP1E9PL57 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NEDD8-MDP1E9PL57 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NEDD8-MDP1E9PL57 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NEDD8-MDP1E9PL57 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NEDD8-MDP1E9PL57 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NEDD8-MDP1E9PL57 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NEDD8-MDP1E9PL57 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NEDD8-MDP1E9PL57 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NEDD8-MDP1E9PL57 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NEDD8-MDP1E9PL57 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NEDD8-MDP1E9PL57 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
NEDD8-MDP1E9PL57 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
NEDD8-MDP1E9PL57 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
NEDD8-MDP1E9PL57 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
NEDD8-MDP1E9PL57 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NEDD8-MDP1E9PL57 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
NEDD8-MDP1E9PL57 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NEDD8-MDP1E9PL57 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NEDD8-MDP1E9PL57 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NEDD8-MDP1E9PL57 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NEDD8-MDP1E9PL57 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NEDD8-MDP1E9PL57 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NEDD8-MDP1E9PL57 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NEDD8-MDP1E9PL57 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NEDD8-MDP1E9PL57 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NEDD8-MDP1E9PL57 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NEDD8-MDP1E9PL57 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NEDD8-MDP1E9PL57 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
NEDD8-MDP1E9PL57 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NEDD8-MDP1E9PL57 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NEDD8-MDP1E9PL57 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NEDD8-MDP1E9PL57 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NEDD8-MDP1E9PL57 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NEDD8-MDP1E9PL57 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NEDD8-MDP1E9PL57 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NEDD8-MDP1E9PL57 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NEDD8-MDP1E9PL57 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NEDD8-MDP1E9PL57 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NEDD8-MDP1E9PL57 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NEDD8-MDP1E9PL57 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NEDD8-MDP1E9PL57 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NEDD8-MDP1E9PL57 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.1 ms