Protein–RNA interactions for Protein: A8MVJ9

Putative histone PARylation factor 1-like, humanhuman

Predictions only

Length 347 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A8MVJ9 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
A8MVJ9 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
A8MVJ9 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
A8MVJ9 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
A8MVJ9 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
A8MVJ9 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
A8MVJ9 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
A8MVJ9 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
A8MVJ9 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
A8MVJ9 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
A8MVJ9 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
A8MVJ9 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
A8MVJ9 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
A8MVJ9 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
A8MVJ9 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
A8MVJ9 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
A8MVJ9 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
A8MVJ9 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
A8MVJ9 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
A8MVJ9 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
A8MVJ9 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
A8MVJ9 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
A8MVJ9 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
A8MVJ9 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
A8MVJ9 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
A8MVJ9 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
A8MVJ9 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
A8MVJ9 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
A8MVJ9 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
A8MVJ9 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
A8MVJ9 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
A8MVJ9 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
A8MVJ9 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
A8MVJ9 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
A8MVJ9 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
A8MVJ9 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
A8MVJ9 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
A8MVJ9 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
A8MVJ9 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
A8MVJ9 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
A8MVJ9 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
A8MVJ9 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
A8MVJ9 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
A8MVJ9 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
A8MVJ9 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
A8MVJ9 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
A8MVJ9 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
A8MVJ9 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
A8MVJ9 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
A8MVJ9 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
A8MVJ9 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
A8MVJ9 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
A8MVJ9 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
A8MVJ9 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
A8MVJ9 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
A8MVJ9 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
A8MVJ9 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
A8MVJ9 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
A8MVJ9 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
A8MVJ9 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
A8MVJ9 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
A8MVJ9 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
A8MVJ9 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
A8MVJ9 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
A8MVJ9 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
A8MVJ9 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
A8MVJ9 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
A8MVJ9 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
A8MVJ9 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
A8MVJ9 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
A8MVJ9 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
A8MVJ9 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
A8MVJ9 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
A8MVJ9 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
A8MVJ9 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
A8MVJ9 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
A8MVJ9 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
A8MVJ9 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
A8MVJ9 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
A8MVJ9 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
A8MVJ9 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
A8MVJ9 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
A8MVJ9 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
A8MVJ9 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
A8MVJ9 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
A8MVJ9 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
A8MVJ9 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
A8MVJ9 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
A8MVJ9 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
A8MVJ9 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
A8MVJ9 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
A8MVJ9 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
A8MVJ9 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
A8MVJ9 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
A8MVJ9 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
A8MVJ9 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
A8MVJ9 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
A8MVJ9 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
A8MVJ9 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
A8MVJ9 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms