Protein–RNA interactions for Protein: A6NKP2

SDR42E2, Putative short-chain dehydrogenase/reductase family 42E member 2, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDR42E2A6NKP2 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SDR42E2A6NKP2 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SDR42E2A6NKP2 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SDR42E2A6NKP2 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SDR42E2A6NKP2 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SDR42E2A6NKP2 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SDR42E2A6NKP2 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SDR42E2A6NKP2 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SDR42E2A6NKP2 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SDR42E2A6NKP2 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SDR42E2A6NKP2 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SDR42E2A6NKP2 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SDR42E2A6NKP2 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SDR42E2A6NKP2 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SDR42E2A6NKP2 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
SDR42E2A6NKP2 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SDR42E2A6NKP2 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
SDR42E2A6NKP2 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SDR42E2A6NKP2 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SDR42E2A6NKP2 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SDR42E2A6NKP2 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SDR42E2A6NKP2 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SDR42E2A6NKP2 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SDR42E2A6NKP2 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SDR42E2A6NKP2 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SDR42E2A6NKP2 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SDR42E2A6NKP2 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SDR42E2A6NKP2 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SDR42E2A6NKP2 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SDR42E2A6NKP2 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SDR42E2A6NKP2 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SDR42E2A6NKP2 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SDR42E2A6NKP2 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SDR42E2A6NKP2 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SDR42E2A6NKP2 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SDR42E2A6NKP2 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SDR42E2A6NKP2 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
SDR42E2A6NKP2 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
SDR42E2A6NKP2 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SDR42E2A6NKP2 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SDR42E2A6NKP2 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
SDR42E2A6NKP2 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SDR42E2A6NKP2 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SDR42E2A6NKP2 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SDR42E2A6NKP2 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
SDR42E2A6NKP2 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SDR42E2A6NKP2 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SDR42E2A6NKP2 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SDR42E2A6NKP2 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SDR42E2A6NKP2 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SDR42E2A6NKP2 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SDR42E2A6NKP2 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SDR42E2A6NKP2 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
SDR42E2A6NKP2 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SDR42E2A6NKP2 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SDR42E2A6NKP2 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SDR42E2A6NKP2 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SDR42E2A6NKP2 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SDR42E2A6NKP2 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SDR42E2A6NKP2 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
SDR42E2A6NKP2 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SDR42E2A6NKP2 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SDR42E2A6NKP2 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SDR42E2A6NKP2 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SDR42E2A6NKP2 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
SDR42E2A6NKP2 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SDR42E2A6NKP2 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SDR42E2A6NKP2 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SDR42E2A6NKP2 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SDR42E2A6NKP2 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SDR42E2A6NKP2 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SDR42E2A6NKP2 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SDR42E2A6NKP2 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SDR42E2A6NKP2 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SDR42E2A6NKP2 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SDR42E2A6NKP2 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SDR42E2A6NKP2 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SDR42E2A6NKP2 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SDR42E2A6NKP2 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SDR42E2A6NKP2 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SDR42E2A6NKP2 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SDR42E2A6NKP2 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SDR42E2A6NKP2 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SDR42E2A6NKP2 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SDR42E2A6NKP2 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SDR42E2A6NKP2 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SDR42E2A6NKP2 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SDR42E2A6NKP2 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SDR42E2A6NKP2 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SDR42E2A6NKP2 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SDR42E2A6NKP2 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SDR42E2A6NKP2 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
SDR42E2A6NKP2 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SDR42E2A6NKP2 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SDR42E2A6NKP2 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SDR42E2A6NKP2 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SDR42E2A6NKP2 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SDR42E2A6NKP2 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SDR42E2A6NKP2 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SDR42E2A6NKP2 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms