Protein–RNA interactions for Protein: A6NK06

ACOD1, Cis-aconitate decarboxylase, humanhuman

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACOD1A6NK06 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ACOD1A6NK06 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACOD1A6NK06 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACOD1A6NK06 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACOD1A6NK06 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACOD1A6NK06 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACOD1A6NK06 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACOD1A6NK06 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACOD1A6NK06 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACOD1A6NK06 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACOD1A6NK06 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACOD1A6NK06 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACOD1A6NK06 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
ACOD1A6NK06 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACOD1A6NK06 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACOD1A6NK06 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACOD1A6NK06 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACOD1A6NK06 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACOD1A6NK06 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACOD1A6NK06 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACOD1A6NK06 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
ACOD1A6NK06 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACOD1A6NK06 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACOD1A6NK06 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACOD1A6NK06 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
ACOD1A6NK06 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACOD1A6NK06 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACOD1A6NK06 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACOD1A6NK06 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACOD1A6NK06 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
ACOD1A6NK06 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACOD1A6NK06 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACOD1A6NK06 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACOD1A6NK06 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACOD1A6NK06 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACOD1A6NK06 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACOD1A6NK06 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACOD1A6NK06 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACOD1A6NK06 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACOD1A6NK06 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACOD1A6NK06 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACOD1A6NK06 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACOD1A6NK06 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACOD1A6NK06 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACOD1A6NK06 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACOD1A6NK06 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACOD1A6NK06 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACOD1A6NK06 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACOD1A6NK06 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACOD1A6NK06 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACOD1A6NK06 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ACOD1A6NK06 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
ACOD1A6NK06 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ACOD1A6NK06 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ACOD1A6NK06 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ACOD1A6NK06 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ACOD1A6NK06 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
ACOD1A6NK06 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
ACOD1A6NK06 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ACOD1A6NK06 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ACOD1A6NK06 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ACOD1A6NK06 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ACOD1A6NK06 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ACOD1A6NK06 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ACOD1A6NK06 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ACOD1A6NK06 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ACOD1A6NK06 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ACOD1A6NK06 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ACOD1A6NK06 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ACOD1A6NK06 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ACOD1A6NK06 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
ACOD1A6NK06 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ACOD1A6NK06 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
ACOD1A6NK06 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ACOD1A6NK06 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ACOD1A6NK06 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ACOD1A6NK06 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ACOD1A6NK06 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ACOD1A6NK06 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ACOD1A6NK06 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ACOD1A6NK06 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ACOD1A6NK06 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ACOD1A6NK06 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ACOD1A6NK06 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ACOD1A6NK06 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ACOD1A6NK06 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ACOD1A6NK06 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ACOD1A6NK06 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ACOD1A6NK06 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ACOD1A6NK06 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ACOD1A6NK06 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
ACOD1A6NK06 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ACOD1A6NK06 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ACOD1A6NK06 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ACOD1A6NK06 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ACOD1A6NK06 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ACOD1A6NK06 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ACOD1A6NK06 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ACOD1A6NK06 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ACOD1A6NK06 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms