Protein–RNA interactions for Protein: A6NFY4

NEMP2, Nuclear envelope integral membrane protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEMP2A6NFY4 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NEMP2A6NFY4 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NEMP2A6NFY4 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NEMP2A6NFY4 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
NEMP2A6NFY4 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NEMP2A6NFY4 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NEMP2A6NFY4 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NEMP2A6NFY4 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NEMP2A6NFY4 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NEMP2A6NFY4 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NEMP2A6NFY4 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NEMP2A6NFY4 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
NEMP2A6NFY4 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NEMP2A6NFY4 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NEMP2A6NFY4 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NEMP2A6NFY4 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NEMP2A6NFY4 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NEMP2A6NFY4 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NEMP2A6NFY4 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NEMP2A6NFY4 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NEMP2A6NFY4 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NEMP2A6NFY4 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NEMP2A6NFY4 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NEMP2A6NFY4 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NEMP2A6NFY4 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NEMP2A6NFY4 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NEMP2A6NFY4 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NEMP2A6NFY4 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
NEMP2A6NFY4 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NEMP2A6NFY4 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NEMP2A6NFY4 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NEMP2A6NFY4 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NEMP2A6NFY4 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NEMP2A6NFY4 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NEMP2A6NFY4 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NEMP2A6NFY4 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NEMP2A6NFY4 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NEMP2A6NFY4 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NEMP2A6NFY4 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NEMP2A6NFY4 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NEMP2A6NFY4 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NEMP2A6NFY4 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
NEMP2A6NFY4 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NEMP2A6NFY4 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
NEMP2A6NFY4 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
NEMP2A6NFY4 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NEMP2A6NFY4 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
NEMP2A6NFY4 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NEMP2A6NFY4 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NEMP2A6NFY4 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NEMP2A6NFY4 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NEMP2A6NFY4 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NEMP2A6NFY4 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NEMP2A6NFY4 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NEMP2A6NFY4 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
NEMP2A6NFY4 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NEMP2A6NFY4 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NEMP2A6NFY4 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NEMP2A6NFY4 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NEMP2A6NFY4 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NEMP2A6NFY4 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NEMP2A6NFY4 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NEMP2A6NFY4 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NEMP2A6NFY4 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NEMP2A6NFY4 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NEMP2A6NFY4 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NEMP2A6NFY4 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NEMP2A6NFY4 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NEMP2A6NFY4 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NEMP2A6NFY4 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NEMP2A6NFY4 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NEMP2A6NFY4 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NEMP2A6NFY4 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NEMP2A6NFY4 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NEMP2A6NFY4 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NEMP2A6NFY4 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NEMP2A6NFY4 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NEMP2A6NFY4 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
NEMP2A6NFY4 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NEMP2A6NFY4 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NEMP2A6NFY4 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NEMP2A6NFY4 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NEMP2A6NFY4 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NEMP2A6NFY4 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NEMP2A6NFY4 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NEMP2A6NFY4 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NEMP2A6NFY4 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NEMP2A6NFY4 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NEMP2A6NFY4 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NEMP2A6NFY4 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
NEMP2A6NFY4 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
NEMP2A6NFY4 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NEMP2A6NFY4 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NEMP2A6NFY4 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
NEMP2A6NFY4 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NEMP2A6NFY4 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NEMP2A6NFY4 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NEMP2A6NFY4 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NEMP2A6NFY4 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
NEMP2A6NFY4 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms