Protein–RNA interactions for Protein: A4QMS7

C5orf49, Uncharacterized protein C5orf49, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C5orf49A4QMS7 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
C5orf49A4QMS7 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
C5orf49A4QMS7 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
C5orf49A4QMS7 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
C5orf49A4QMS7 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
C5orf49A4QMS7 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
C5orf49A4QMS7 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
C5orf49A4QMS7 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
C5orf49A4QMS7 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
C5orf49A4QMS7 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
C5orf49A4QMS7 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
C5orf49A4QMS7 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
C5orf49A4QMS7 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
C5orf49A4QMS7 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
C5orf49A4QMS7 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
C5orf49A4QMS7 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
C5orf49A4QMS7 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
C5orf49A4QMS7 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
C5orf49A4QMS7 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
C5orf49A4QMS7 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
C5orf49A4QMS7 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
C5orf49A4QMS7 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
C5orf49A4QMS7 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
C5orf49A4QMS7 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
C5orf49A4QMS7 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
C5orf49A4QMS7 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
C5orf49A4QMS7 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
C5orf49A4QMS7 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
C5orf49A4QMS7 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
C5orf49A4QMS7 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
C5orf49A4QMS7 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
C5orf49A4QMS7 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
C5orf49A4QMS7 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
C5orf49A4QMS7 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
C5orf49A4QMS7 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
C5orf49A4QMS7 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
C5orf49A4QMS7 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
C5orf49A4QMS7 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
C5orf49A4QMS7 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
C5orf49A4QMS7 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
C5orf49A4QMS7 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
C5orf49A4QMS7 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
C5orf49A4QMS7 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC15.8■□□□□ 0.12
C5orf49A4QMS7 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
C5orf49A4QMS7 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
C5orf49A4QMS7 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
C5orf49A4QMS7 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
C5orf49A4QMS7 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
C5orf49A4QMS7 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
C5orf49A4QMS7 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
C5orf49A4QMS7 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
C5orf49A4QMS7 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
C5orf49A4QMS7 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
C5orf49A4QMS7 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
C5orf49A4QMS7 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
C5orf49A4QMS7 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
C5orf49A4QMS7 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
C5orf49A4QMS7 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
C5orf49A4QMS7 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
C5orf49A4QMS7 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
C5orf49A4QMS7 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
C5orf49A4QMS7 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
C5orf49A4QMS7 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
C5orf49A4QMS7 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
C5orf49A4QMS7 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
C5orf49A4QMS7 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
C5orf49A4QMS7 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
C5orf49A4QMS7 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
C5orf49A4QMS7 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
C5orf49A4QMS7 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
C5orf49A4QMS7 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
C5orf49A4QMS7 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
C5orf49A4QMS7 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
C5orf49A4QMS7 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
C5orf49A4QMS7 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
C5orf49A4QMS7 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
C5orf49A4QMS7 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
C5orf49A4QMS7 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
C5orf49A4QMS7 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
C5orf49A4QMS7 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
C5orf49A4QMS7 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
C5orf49A4QMS7 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
C5orf49A4QMS7 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
C5orf49A4QMS7 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
C5orf49A4QMS7 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
C5orf49A4QMS7 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
C5orf49A4QMS7 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
C5orf49A4QMS7 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
C5orf49A4QMS7 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
C5orf49A4QMS7 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
C5orf49A4QMS7 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
C5orf49A4QMS7 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
C5orf49A4QMS7 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
C5orf49A4QMS7 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
C5orf49A4QMS7 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
C5orf49A4QMS7 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
C5orf49A4QMS7 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
C5orf49A4QMS7 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
C5orf49A4QMS7 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
C5orf49A4QMS7 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms