Protein–RNA interactions for Protein: A3QJZ6

PRAMEF22, PRAME family member 22, humanhuman

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF22A3QJZ6 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PRAMEF22A3QJZ6 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PRAMEF22A3QJZ6 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PRAMEF22A3QJZ6 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
PRAMEF22A3QJZ6 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
PRAMEF22A3QJZ6 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PRAMEF22A3QJZ6 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PRAMEF22A3QJZ6 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PRAMEF22A3QJZ6 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PRAMEF22A3QJZ6 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PRAMEF22A3QJZ6 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
PRAMEF22A3QJZ6 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PRAMEF22A3QJZ6 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PRAMEF22A3QJZ6 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PRAMEF22A3QJZ6 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PRAMEF22A3QJZ6 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PRAMEF22A3QJZ6 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PRAMEF22A3QJZ6 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PRAMEF22A3QJZ6 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PRAMEF22A3QJZ6 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PRAMEF22A3QJZ6 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
PRAMEF22A3QJZ6 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PRAMEF22A3QJZ6 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PRAMEF22A3QJZ6 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PRAMEF22A3QJZ6 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PRAMEF22A3QJZ6 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
PRAMEF22A3QJZ6 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
PRAMEF22A3QJZ6 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
PRAMEF22A3QJZ6 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PRAMEF22A3QJZ6 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PRAMEF22A3QJZ6 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PRAMEF22A3QJZ6 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PRAMEF22A3QJZ6 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PRAMEF22A3QJZ6 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PRAMEF22A3QJZ6 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PRAMEF22A3QJZ6 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PRAMEF22A3QJZ6 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PRAMEF22A3QJZ6 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PRAMEF22A3QJZ6 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PRAMEF22A3QJZ6 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PRAMEF22A3QJZ6 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PRAMEF22A3QJZ6 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PRAMEF22A3QJZ6 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PRAMEF22A3QJZ6 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PRAMEF22A3QJZ6 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PRAMEF22A3QJZ6 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PRAMEF22A3QJZ6 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PRAMEF22A3QJZ6 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PRAMEF22A3QJZ6 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PRAMEF22A3QJZ6 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
PRAMEF22A3QJZ6 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PRAMEF22A3QJZ6 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PRAMEF22A3QJZ6 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PRAMEF22A3QJZ6 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PRAMEF22A3QJZ6 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PRAMEF22A3QJZ6 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PRAMEF22A3QJZ6 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PRAMEF22A3QJZ6 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
PRAMEF22A3QJZ6 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PRAMEF22A3QJZ6 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PRAMEF22A3QJZ6 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PRAMEF22A3QJZ6 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PRAMEF22A3QJZ6 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PRAMEF22A3QJZ6 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PRAMEF22A3QJZ6 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PRAMEF22A3QJZ6 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PRAMEF22A3QJZ6 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PRAMEF22A3QJZ6 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PRAMEF22A3QJZ6 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PRAMEF22A3QJZ6 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PRAMEF22A3QJZ6 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PRAMEF22A3QJZ6 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PRAMEF22A3QJZ6 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
PRAMEF22A3QJZ6 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PRAMEF22A3QJZ6 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PRAMEF22A3QJZ6 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
PRAMEF22A3QJZ6 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PRAMEF22A3QJZ6 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PRAMEF22A3QJZ6 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PRAMEF22A3QJZ6 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PRAMEF22A3QJZ6 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PRAMEF22A3QJZ6 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PRAMEF22A3QJZ6 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PRAMEF22A3QJZ6 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PRAMEF22A3QJZ6 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PRAMEF22A3QJZ6 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
PRAMEF22A3QJZ6 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
PRAMEF22A3QJZ6 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC23■■□□□ 1.27
PRAMEF22A3QJZ6 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PRAMEF22A3QJZ6 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PRAMEF22A3QJZ6 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PRAMEF22A3QJZ6 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC23■■□□□ 1.27
PRAMEF22A3QJZ6 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PRAMEF22A3QJZ6 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PRAMEF22A3QJZ6 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC23■■□□□ 1.27
PRAMEF22A3QJZ6 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
PRAMEF22A3QJZ6 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
PRAMEF22A3QJZ6 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
PRAMEF22A3QJZ6 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PRAMEF22A3QJZ6 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.9 ms