Protein–RNA interactions for Protein: A2RUR9

CCDC144A, Coiled-coil domain-containing protein 144A, humanhuman

Predictions only

Length 1,427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC144AA2RUR9 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CCDC144AA2RUR9 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CCDC144AA2RUR9 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CCDC144AA2RUR9 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CCDC144AA2RUR9 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
CCDC144AA2RUR9 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
CCDC144AA2RUR9 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CCDC144AA2RUR9 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CCDC144AA2RUR9 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CCDC144AA2RUR9 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CCDC144AA2RUR9 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CCDC144AA2RUR9 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CCDC144AA2RUR9 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CCDC144AA2RUR9 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CCDC144AA2RUR9 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
CCDC144AA2RUR9 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
CCDC144AA2RUR9 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CCDC144AA2RUR9 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
CCDC144AA2RUR9 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CCDC144AA2RUR9 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CCDC144AA2RUR9 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CCDC144AA2RUR9 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CCDC144AA2RUR9 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CCDC144AA2RUR9 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CCDC144AA2RUR9 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CCDC144AA2RUR9 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CCDC144AA2RUR9 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CCDC144AA2RUR9 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CCDC144AA2RUR9 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CCDC144AA2RUR9 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CCDC144AA2RUR9 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CCDC144AA2RUR9 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CCDC144AA2RUR9 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CCDC144AA2RUR9 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CCDC144AA2RUR9 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CCDC144AA2RUR9 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CCDC144AA2RUR9 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CCDC144AA2RUR9 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
CCDC144AA2RUR9 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CCDC144AA2RUR9 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CCDC144AA2RUR9 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
CCDC144AA2RUR9 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
CCDC144AA2RUR9 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
CCDC144AA2RUR9 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CCDC144AA2RUR9 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CCDC144AA2RUR9 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CCDC144AA2RUR9 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CCDC144AA2RUR9 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CCDC144AA2RUR9 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CCDC144AA2RUR9 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CCDC144AA2RUR9 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
CCDC144AA2RUR9 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
CCDC144AA2RUR9 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CCDC144AA2RUR9 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CCDC144AA2RUR9 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CCDC144AA2RUR9 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CCDC144AA2RUR9 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CCDC144AA2RUR9 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CCDC144AA2RUR9 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CCDC144AA2RUR9 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CCDC144AA2RUR9 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CCDC144AA2RUR9 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CCDC144AA2RUR9 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CCDC144AA2RUR9 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CCDC144AA2RUR9 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CCDC144AA2RUR9 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CCDC144AA2RUR9 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CCDC144AA2RUR9 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CCDC144AA2RUR9 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CCDC144AA2RUR9 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CCDC144AA2RUR9 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
CCDC144AA2RUR9 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CCDC144AA2RUR9 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CCDC144AA2RUR9 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CCDC144AA2RUR9 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CCDC144AA2RUR9 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CCDC144AA2RUR9 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CCDC144AA2RUR9 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CCDC144AA2RUR9 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
CCDC144AA2RUR9 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CCDC144AA2RUR9 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CCDC144AA2RUR9 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CCDC144AA2RUR9 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CCDC144AA2RUR9 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CCDC144AA2RUR9 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CCDC144AA2RUR9 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
CCDC144AA2RUR9 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CCDC144AA2RUR9 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CCDC144AA2RUR9 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CCDC144AA2RUR9 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CCDC144AA2RUR9 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CCDC144AA2RUR9 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CCDC144AA2RUR9 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CCDC144AA2RUR9 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CCDC144AA2RUR9 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CCDC144AA2RUR9 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CCDC144AA2RUR9 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
CCDC144AA2RUR9 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CCDC144AA2RUR9 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CCDC144AA2RUR9 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms